AnimalTFDB 3.0：动物转录因子注释和预测的综合资源库
转录因子（Transcription factor，TF）是一类能够以序列特异性方式结合DNA并对基因转录起关键调控作用的蛋白质，在各种生物过程和疾病发生中起非常关键的作用。鉴定、分类和注释转录因子以及分析转录因子的调控和功能等一直是研究的热点和基础，它们在生物体内形成一套指导基因表达的复杂系统引得众多科学家浓厚的研究兴趣。
为了揭开TF在生物体内调节机制的神秘面纱，科学家们探索了许多实验方法（如CHIP-seq）和预测工具（如seq logo，Jaspar数据库等）。
下面介绍由华中科技大学生命科学与技术学院郭安源教授团队开发的动物转录因子注释和预测数据库（AnimalTFDB）。
AnimalTFDB数据库建设工作于2011年11月完成了第一版，至今持续维护和更新了7年，三个版本的文章分别都发表在牛津大学出版社(Oxford University Press)出版物《核酸研究》(Nucleic Acids Research)（2017年影响因子11.56），最新的3.0版本文章于2018年9月11日在线发表
1. AnimalTFDB 3.0 概览
AnimalTFDB 3.0版本中作者鉴定、分类和注释了97个物种全基因组水平的125,135个TF基因和80,060个转录辅因子基因。其中，根据转录因子DNA结合结构域（DBD），将TF进一步分为73个家族，根据TF辅助因子功能分为83个家族。新版本除了在数据上的扩展外，还提供多种搜索浏览方式（Famliy、Species或自定义搜索）、2个在线预测工具Predict TF和Predict TFBS（分别可以批量预测转录因子和预测DNA序列上的转录因子结合位点）、Blast工具和数据下载功能。因为人类转录因子使用的广泛需求，作者在新版AnimalTFDB数据库中单独设计了一个人类TF数据库网络界面（HumanTFDB：文末）。文章剩余内容<<<<
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