PubMed是美国国家医学图书馆下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,是国际公认、首选生物医学文献免费检索系统,也是许多医学科研人员最常用的信息检索系统。高效利用PubMed可以让科研过程事半功倍。下面就让小诺带大家了解一下如何用PubMed进行文献检索吧。

首先打开PubMed的主页,网址https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/。打开主页后可以看到下面这个简洁大方的界面

我们先来尝试一下最基本的普通检索,在页面上方的输入框中输入要检索的检索词,点击Search,即可进行简单检索。以肺癌“lung cancer”为例。下图为普通检索“lung cancer”所得到的结果:

在检索结果页面中,我们可以看到根据检索词所搜到的文献列表,这些文献有的可以看到全文,有的只有摘要。根据我们关注的角度,可以在页面中按需求设置检索结果的排序方式,比如可以按日期、相关程度、作者、期刊名等等进行设置。

在左侧的检索字段选项里,可以对检出结果进行限定,比如全文/摘要、文献类型、研究类型等等,通过这些设置进一步检索我们需要的文献。在确定好检索结果后,可以通过输入框下方的“save”键进行检索结果的导出。

当然,PubMed是一个功能很强大的数据库,学会基本检索就像开枪只会扣动扳机一样简单,接下来我们了解一下如何使用准星去瞄准目标——高级检索。

举个简单的例子,研究利妥昔单抗治疗类风湿关节炎疗效。先确定检索词,这里我们要研究的对象是类风湿关节炎(rheumatoid arthritis),干预措施是利妥昔单抗(rituximab),我们先在高级检索框里对这两个词进行检索。

那么在哪儿进行高级检索呢?我们还是回到PubMed网址的首页,点击检索框下方的Advanced检索入口,进入高级检索界面。

1)在检索框里输入检索词rituximab,在左侧的下来菜单里设定检索字段,点击ADD,创建一条检索式。经过主题词MeSH检索,我们发现rituximab是一个MeSH,那么我们在左侧检索字段里设定为Mesh Terms。

2)除了MeSH以外,rituximab还有许多自由词,我们可以在Title/Abstract里进行查找,词和词之间用” OR “进行连接。小伙伴们可以看下面的图,同样是输入检索词,设置好检索字段,然后在检索框后面的下拉菜单里选择“OR”点击,这样输入的检索词就添加到下面的检索式中了,是不是很简单呢?

3)当所有的检索词都添加好以后,可以直接点击“Search”,也可以点击“Add to history”添加检索历史,检索文献的同时记录检索策略。在这里我们可以看到,有关利妥昔单抗的文献,在PubMed里面检出了一万五千多篇。

同理可得类风湿关节炎rheumatoid arthritis相关文献。

4)将两次检索的结果用“ AND ”进行连接,得出利妥昔单抗治疗类风湿关节炎的相关文献。

另外,我们还可以通过对研究设计类型的限定对文献进一步缩小检出文献的范围,相应的各种研究设计检索策略已经有文献检索专家写好了,有兴趣的小伙伴可以上网搜一下search filters,无数医学文献检索前辈的智慧结晶就在那里,等着你去发现,选择最适合你的,然后copy-paste&search。

关于如何使用PubMed进行文献检索就先介绍到这里,最后做一个小小的总结(见下图)。

转自:小诺科研微信公众号

python批量检索文献pubmed_如何使用PubMed高效检索文献相关推荐

  1. python批量搜索关键字_多关键字是高效的搜索关键字

    这属于"天真"阵营,但这里有一种方法,将集合作为思考的食粮:docs = [ """ Here's a sentence with dog and a ...

  2. python批量检索文献pubmed_Pubmed检索实用指南:精准搜索和全文下载

    PubMed是国际上公认的最具权威的生物医学文献数据库,检索文献用Pubmed,一般人都知道.不过嗵嗵还是会经常收到读者关于Pubmed和文献检索各种各样的问题,今天咱们就一次性解决问题,把Pubme ...

  3. python批量检索文献pubmed_PubMed快速检索文献,学学这些技巧!

    原标题:PubMed快速检索文献,学学这些技巧! PubMed为科研路上必不可少的数据库,今天传授PubMed高手常用的7个技巧,让你快速找到自己想要的文献. 1,获取全文技巧 Pubmed提供的文献 ...

  4. python批量检索文献_基于Python的文献检索系统设计与实现

    基于 Python 的文献检索系统设计与实现 杜兰 ; 刘智 ; 陈琳琳 [期刊名称] <软件> [年 ( 卷 ), 期] 2020(041)001 [摘要] 毕业设计是大学本科教育的一个 ...

  5. python批量检索文献_Python+Selenium,让浏览器自动帮你下文献

    在做学术.搞科研的过程中,我们往往需要针对一个特定的主题下载海量的文献.在把几百篇文献下载到电脑的过程中,假如遇到不够友好的数据库不提供批量下载的功能,怎么办?我恰好遇到了这样的批量下载的科研任务和批 ...

  6. python爬取pubmed的文献_爬虫获取pubmed中文献的标题和摘要

    为了满足快速浏览pubmed中相关文献标题和摘要的需求,写了个简单的爬虫(目前只实现了单个关键词以及多个关键词的and检索),用于批量获取感兴趣文献的标题和摘要. 使用编辑器是python,所编写的爬 ...

  7. pubmedy安装不聊了_在PubMed基本检索框中输入immunology检索出的文献为1115106 篇,这是利用了PubMed哪一种检索技术?...

    参考答案如下 在PubMed基本检索框中输入immunology检索出的文献为1115106 篇,中输种检这是利用了PubMed哪一种检索技术? 基y检Which band became extrem ...

  8. python批量提取word指定内容_使用python批量读取word文档并整理关键信息到excel表格的实例...

    目标 最近实验室里成立了一个计算机兴趣小组 倡议大家多把自己解决问题的经验记录并分享 就像在CSDN写博客一样 虽然刚刚起步 但考虑到后面此类经验记录的资料会越来越多 所以一开始就要做好模板设计(如下 ...

  9. 如何使用python批量下载-用Python调用迅雷实现后台批量下载

    迅雷9.10实测可用,老版本迅雷应该也可以用,不推荐迅雷极速版 写在前面 最近在学习python的网络爬虫,想要爬取某个网站上的上百万条链接,批量下载链接所指向的图片.文档.视频等内容.大部分的小文件 ...

最新文章

  1. 吴恩达deeplearning.ai最后一课上线,下一次得等多少年?
  2. Android点击图标重新启动问题
  3. 对于python来说、一个模块就是一个文件-彻底明白Python package和模块
  4. 看完你会为自己哭,或者为他们哭
  5. 移动硬盘拷贝linux文件,Linux下使用移动硬盘拷贝数据
  6. 智能可穿戴平台,你更看好谁?
  7. 【PMP】Head First PMP 学习笔记 第十章 沟通管理
  8. java图形界面_学习Java有什么用?Java的应用领域有哪些?
  9. 利用java poi对excel表的读写操作
  10. 1006. 换个格式输出整数 (15)-PAT乙级真题
  11. python如何升级_python pip如何升级
  12. Hive数据导出入门
  13. 【渝粤教育】国家开放大学2018年春季 8668-21T汽车涂装技术(A) 参考试题
  14. atitit.研发管理--标准化流程总结---java开发环境与项目部署环境的搭建工具包总结
  15. 断面测量数据格式转换
  16. 计算机的用户账户,计算机用户名是什么意思(如何修改和设置用户名)
  17. 什么是单点故障【转载】
  18. 使用python及相关库实现AQI分析与预测
  19. OpenCvSharp 棋盘格标定助手
  20. 【Java】Java实现找图抓色

热门文章

  1. 内存泄漏检测工具asan
  2. 技术前沿---5G技术的实现原理
  3. Android设备root及xposedPrivacy的安装
  4. JavaWeb - 小米商城:登录与退出
  5. windows10 训练word2vec 中文语料
  6. 【其他】手机bilibili的视频文件在哪个目录
  7. 右键-打开方式里没有EXCEL,找到路径也打不开的解决方法
  8. Kettle 6.1:Triggering heartbeat signal for ... at every 10 seconds 问题解决
  9. 关于CodeBlocks下载了带mingw版本的依旧无法编译运行的解决方案
  10. 【笔试】京东数据分析暑期实习