【转】DICOM图像像素值（灰度值）转换为CT值

转自：https://www.cnblogs.com/xuhui24/p/6193032.html
https://zhuanlan.zhihu.com/p/358770379

　　CT值的单位是Hounsfield，简称为Hu，范围是-1024-3071。用于衡量人体组织对X射线的吸收率，设定水的吸收率为0Hu。

　　在DICOM图像读取的过程中，我们会发现图像的像素值有可能不是这个范围，通常是0-4096，这是我们常见到的像素值或者灰度值，这就需要我们在图像像素值（灰度值）转换为CT值。

　　首先，需要读取两个DICOM Tag信息，（0028|1052）：rescale intercept和（0028|1053）：rescale slope.

　　然后通过公式：

　　　　Hu = pixel * slope + intercept

　　计算得到CT值。

HU（Hounsfiled Unit）值，是在做医学图像数据预处理不可避免的事情，反映了组织对X射线吸收程度。以水的吸收程度作为参考，即水的HU=0，衰减系数大于水的为正直，小于水的为负值。并以骨皮质和空气的HU值为上限和下限，是在医学影像图像处理技术，处理CT图像不可避免的事情。

HU值的计算公式：（非常重要）

HU = pixel_val * slope + intercept

（如果Slope为1，Intercept为0，则不需要转化的问题，具体Slope和Intercept的值在头文件中都会有说明的）

代码：

import os
import numpy as np
import pydicom as pyd
import matplotlib.pyplot as plt
import cv2
import SimpleITK as sitk

##查看是否需要转化HU值，如果img.RescaleSlope不为1，img.RescaleIntercept不为0，则需要转化的问题
dcm_file='/Pancreas-CT/PANCREAS_0001/11-24-2015-PANCREAS0001-Pancreas-18957/Pancreas-99667/1-001.dcm'

img=pyd.read_file(dcm_file)
img_array=sitk.GetArrayFromImage(sitk.ReadImage(dcm_file))
print(img_array)
print(np.shape(img_array))
print('----')
print(img.RescaleSlope)
print(img.RescaleIntercept)
HU=np.dot(img_array,img.RescaleSlope)+img.RescaleSlope
print(HU)

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