马尔可夫模型 | Python实现生成和拟合隐马尔可夫模型（HMM）
效果一览
文章概述
马尔可夫模型 | Python实现生成和拟合隐马尔可夫模型（HMM）
研究内容
用于分析固定分子的单对 FRET 迹线。 它分为 10 个部分来加载和预处理迹线，生成和拟合隐马尔可夫模型（HMM），并评估预测和拟合结果.隐马尔可夫过程和模型优化的基本实现基于 python 库 hmmlearn的内置函数。 hmmlearn 需要 C 编译器。 如果您没有安装 C 编译器，安装 hmmlearn 会出现错误。
创建新环境（可选）
创建新的python环境来安装所需的包Anaconda 提示符示例： conda create -n hmm
安装hmmlearn
pip install --upgrade --user hmmlearn
如果pip安装失败，可以尝试直接下载安装wheel。
(alternative: download wheel from http://pypi.fcio.net/simple/hmmlearn/ and install with pip install PATH_TO_WHEEL)完整功能需要以下软件包
马尔可夫模型 | Python实现生成和拟合隐马尔可夫模型（HMM）相关推荐
- python地图匹配_基于隐马尔科夫模型(HMM)的地图匹配(Map-Matching)算法
1. 摘要 本篇博客简单介绍下用隐马尔科夫模型(Hidden Markov Model, HMM)来解决地图匹配(Map-Matching)问题.转载请注明网址. 2. Map-Matching(MM ...
- 【深度剖析HMM（附Python代码）】2.隐马尔科夫链HMM的EM训练过程
隐马尔科夫链HMM的参数θ的EM训练过程 现在回到前一节最后提出的参数θ的最大似然函数上来,先对其做个对数变换,做对数变换是考虑到序列X的概率计算公式中包含了连乘,为了方便计算同时避免序列X的概率过小 ...
- 机器学习之概率图模型（贝叶斯概率，隐马尔科夫模型）
一.贝叶斯公式 在学习概率图模型之前先要了解贝叶斯公式: 由公式(1),(2)可得: 这便是贝叶斯公式,其中条件概率P(A/B)称为后验概率,概率P(A),P(B)称为先验概率,条件概率P(B/A), ...
- Python Train_使用隐马尔可夫模型进行音乐流派分类的Python实现
音乐类型分类一直是音乐信息检索领域研究的热点问题.在本教程中,我们将尝试使用隐马尔可夫模型对音乐类型进行分类,隐马尔可夫模型非常擅长对时间序列数据进行建模.由于音乐音频文件是时间序列信号,我们希望HM ...
- 使用隐马尔可夫模型生成数据
隐马尔可夫模型是一个强大的分析时间序列数据的分析工具.假定被建模的系统是带有隐藏状态的马尔可夫过程,这意味着底层系统可以是一组可能的状态之一,系统经历一系列的状态转换,从而产生一系列输出.我们仅能观察 ...
- 【深度】从朴素贝叶斯到维特比算法：详解隐马尔科夫模型
详解隐马尔科夫模型 作者:David S. Batista 选自:机器之心 本文首先简要介绍朴素贝叶斯,再将其扩展到隐马尔科夫模型.我们不仅会讨论隐马尔科夫模型的基本原理,同时还从朴素贝叶斯的角度讨论 ...
- 隐马尔科夫模型模型：原理、实现
文章目录 引入 盒子模型与盒子问题(urn problem) 随机过程 索引集 状态空间 采样函数 增量 马尔可夫链与马尔可夫过程 隐马尔科夫模型定义 示例--帮助理解 精灵.盒子与球 天气估计 原理 ...
- 学习笔记——详解马尔可夫，马尔可夫链，马尔可夫模型，隐马
目录 (一),马尔可夫 (Markov)综述 1.1,随机过程是啥玩意儿 1.2. 马尔可夫链 (Markov Chain)又是什么鬼 1.3一个经典的马尔科夫链实例 (二), 隐马尔可夫 HMM 2 ...
- 机器学习理论《统计学习方法》学习笔记：第十章 隐马尔可夫模型（HMM）
第十章 隐马尔可夫模型(HMM) 摘要 隐马尔可夫模型的基本概念 前言 生成模型和判别模型 马尔可夫过程 马尔可夫链 马尔可夫模型 隐马尔可夫模型 隐马尔可夫模型的三个问题 第一 概率计算 第二 学习 ...
最新文章
- python json.loads()中文问题-python中文编码json中文输出问题
- phpMyAdmin 配置
- kdj买卖指标公式源码_通达信指标公式源码MACD背离KDJ背离指标
- 查询本地内存的栈大小_Js的内存问题
- STL应用--SORT自定义排序
- 编写高效的C++程序方法之使用对象池
- Fundamentals of speech signal processing
- 算法:Reverse Words in a String(翻转字符串里的单词)
- mysql case when like_mysql 中casewhen用法
- python实现指纹识别毕业论文_指纹识别算法实现-毕业论文
- Win11右下角音量图标不见了怎么办
- python3爬虫下载音乐_python3.4爬虫批量下载音乐
- psp/psvita联机工具xlinkhandheldassistant，平台Xlink Kai
- ERP系统有哪些品牌？
- TikTok不可思议的崛起
- springboot继承JpaRepository报org.springframework.beans.factory.NoSuchBeanDefinitionException: No qualif
- STM8S EEPROM 操作
- c语言for循环顺序,关于C语言中for循环的执行顺序
- linux usbmon分析数据,Linux 鼠标usbmon数据
- “实现能力”与“设计能力”