Linux Blas安装方法,科研1-linux下安装blas和lapack
相关链接:http://blog.csdn.net/mlnotes/article/details/9676269
http://blog.sina.com.cn/s/blog_5f350c9601014ejc.html
这两个数学库是很多linux科学计算软件需要调用的,所以经常会用到。
LAPACK,其名为Linear Algebra PACKage的缩写,是一以Fortran编程语言写就,用于数值计算的函式集。
LAPACK提供了丰富的工具函式,可用于诸如解多元线性方程式、线性系统方程组的最小平方解、计算特征向量、用于计算矩阵QR分解的Householder转换、以及奇异值分解等问题。
LAPACK的源码可以从http://www.netlib.org/lapack/处下载,BLAS也包含在其中。
BLAS,全称Basic Linear Algebra
Subprograms,即基础线性代数子程序库,里面拥有大量已经编写好的关于线性代数运算的程序。
BLAS的源码可以从http://www.netlib.org/blas/下载,但实际上LAPACK中已经包含了BLAS。
1.确保机器上安装了gfortran编译器,如果没有安装的话,可以使用sudo apt-get install
gfortran
2.下载blas, cblas, lapack 源代码, 这些源码都可以在
http://www.netlib.org 上找到,下载并解压。这里提供我安装时的下载链接
http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
http://www.netlib.org/blas/blast-forum/cblas.tgz
http://www.netlib.org/lapack/lapack-3.4.2.tgz,解压之后会有三个文件夹,BLAS,
CBLAS, lapack-3.4.2
3.这里就是具体的编译步骤
1)编译blas, 进入BLAS文件夹,执行以下几条命令
gfortran -c
-O3 *.f # 编译所有的 .f 文件,生成 .o文件
ar rv libblas.a *.o # 链接所有的 .o文件,生成
.a 文件
su cp libblas.a /usr/local/lib #
将库文件复制到系统库目录
2)编译cblas, 进入CBLAS文件夹,首先根据你自己的计算机平台,将目录下某个 Makefile.XXX
复制为 Makefile.in , XXX表示计算机的平台,如果是Linux,那么就将Makefile.LINUX 复制为
Makefile.in,然后执行以下命令
cp ../BLAS/libblas.a
testing # 将上一步编译成功的 libblas.a
复制到 CBLAS目录下的testing子目录
make # 编译所有的目录
sudo cp lib/cblas_LINUX.a /usr/local/lib/libcblas.a #
将库文件复制到系统库目录下
3)编译
lapack以及lapacke,这一步比较麻烦,首先当然是进入lapack-3.4.2文件夹,然后根据平台的特点,将INSTALL目录下对应的make.inc.XXX
复制一份到 lapack-3.4.2目录下,并命名为make.inc, 这里我复制的是
INSTALL/make.inc.gfortran,因为我这里用的是gfortran编译器。
修改lapack-3.4.2/Makefile,
因为lapack以来于blas库,所以需要做如下修改
#lib: lapacklib tmglib
lib: blaslib variants lapacklig tmglib
make # 编译所有的lapack文件
cd lapacke # 进入lapacke 文件夹,这个文件夹包含lapack的C语言接口文件
make # 编译lapacke
cp include/*.h /usr/local/include
#将lapacke的头文件复制到系统头文件目录
cd .. #返回到 lapack-3.4.2 目录
cp *.a /usr/local/lib # 将生成的所有库文件复制到系统库目录
这里的头文件包括: lapacke.h, lapacke_config.h, lapacke_mangling.h,
lapacke_mangling_with_flags.h lapacke_utils.h
生成的库文件包括:liblapack.a, liblapacke.a, librefblas.a,
libtmglib.a
至此cblas和lapack就成功安装到你的电脑上了。
测试:
可以到 LAPACKE 找测试代码,这里是lapacke的官方文档,比如以下代码:
#include
#include
int main (int argc, const char * argv[])
{
double a[5*3] =
{1,2,3,4,5,1,3,5,2,4,1,4,2,5,3};
double b[5*2] =
{-10,12,14,16,18,-3,14,12,16,16};
lapack_int
info,m,n,lda,ldb,nrhs;
int i,j;
m = 5;
n = 3;
nrhs = 2;
lda = 5;
ldb = 5;
info =
LAPACKE_dgels(LAPACK_COL_MAJOR,'N',m,n,nrhs,a,lda,b,ldb);
for(i=0;i
{
for(j=0;j
{
printf("%lf ",b[i+ldb*j]);
}
printf("\n");
}
return(info);
}
将上诉代码保存为test.c,编译时,别忘了使用gfortran,此外,还需要连接用到的库,编译上面的代码,应使用如下命令:
gfortran test.c -llapacke
-llapack -lrefblas
如果能正常编译,即表示安装成功。如果要了解这段代码的具体含义,可以到 LAPACKE
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