amt630a芯片中文资料_甲基化芯片学习记录
今天是生信星球陪你的第539天
大神一句话,菜鸟跑半年。我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~
就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~
这里有豆豆和花花的学习历程,从新手到进阶,生信路上有你有我!
第一部分,学习甲基化的基础知识,参考资料:
甲基化的基础知识
![](/assets/blank.gif)
第二部分,甲基化芯片分析的一般流程,包括了甲基化信号值的概念,可以做什么分析等,参考资料:
甲基化芯片的一般分析流程
![](/assets/blank.gif)
第三部分 Bioconductor的代码流程
主要是使用了R包minfi做质控和标准化。
中文导读:Bioconductor的DNA甲基化芯片分析流程
原文网址:http://www.bioconductor.org/help/workflows/methylationArrayAnalysis/
![](/assets/blank.gif)
最后曾老板给的标准流程,包括数据下载、质控及差异分析、富集分析,香!
数据下载:甲基化芯片数据下载如何读入到R里面
质控:甲基化芯片数据的一些质控指标
一个甲基化芯片信号值矩阵差异分析的标准代码
![](/assets/blank.gif)
学完这些对甲基化芯片有了一定的了解,还需要多看些文献,加油!
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