MOSES | 分子生成模型的基准平台

MOSES简介

深度生成模型因发现新的分子和材料而迅速流行。这样的模型可以从大量的分子结构中学习并产生新的化合物。这项工作中介绍了分子集（MOSES），一个基准平台，可支持针对药物发现的机器学习研究。 MOSES实现了几种流行的分子生成模型，并提供了一组指标来评估所生成分子的质量和多样性。借助MOSES，旨在标准化分子生成研究，并促进新模型的共享和比较。

MOSES安装

pip install molsets

MOSES示例

导入库

import pandas as pd
from rdkit import Chem
from moses.metrics import get_all_metrics

载入数据

gen = ['CNC', 'Oc1ccccc1-c1cccc2cnccc12','CCCP','Cc1noc(C)c1CN(C)C(=O)Nc1cc(F)cc(F)c1','Cc1nc(NCc2ccccc2)no1-c1ccccc1']

评估

get_all_metrics(gen)<

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