DeepChem | 基于DeepChem的GCN预测化合物溶解度

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from rdkit import Chem
from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
from rdkit.Chem import Draw
import deepchem as dc
import numpy as np
import tensorflow as tf
from deepchem.models import GraphConvModel

载入数据

data = open('delaney-processed.csv')

特征化

delaney_tasks = ['measured log solubility in mols per litre']
featurizer = dc.feat.ConvMolFeaturizer()
loader = dc.data.CSVLoader(tasks=delaney_tasks, smiles_field="smiles", featurizer=featurizer)
dataset = loader.featurize(data, shard_size=8192)# Initialize trans

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