Chemistry.AI | 基于卷积神经网络(CNN)预测分子特性
CNN :Convolutional Neural Networks (卷积神经网络 )
环境准备
- Python版本:Python 3.6.8
- PyTorch版本:PyTorch1.1.0
- RDKit版本:RDKit 2020.03.1
基于卷积神经网络(CNN)预测分子特性
导入库
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem.Crippen import MolLogP
import numpy as np
import torch
import time
载入数据
maxlen = 64
with open('smiles.txt') as f:smiles = f.readlines()[:]smiles = [s.strip() for s in smiles]smiles = [s.split()[1] for s in smiles]smiles = [s for s in smiles if len(s)<maxl
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