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Q1

MedeA-VASP模块中可以自己修改INCAR文件吗?

可以,如果在MedeA-VASP用户图形界面上设置的参数无法满足您的计算需求,可以直接在Add to Input面板上,自行添加VASP相关的INCAR参数,如果添加的参数与之前面板设置的参数有冲突,MedeA-VASP会以您最后在Add to Input面板中添加的参数为准。如图:

Q2

结构优化时,IBRION的值在哪里设置修改?

打开MedeA-VASP用户图形界面,在第一个Calculation面板处,如果选择Type of Calculation为Structure Optimization,则下图红框处Update algorithm选择Conjugate Gradient(CG,共轭梯度方法)对应IBRION=2.

Update algorithm选择RMM-DIIS(最速下降法)则对应IBRION=3.

如果需要其他IBRION的值,可到Add to Input面板处自行添加修改。

若Type of calculation选择的是Single Point,则默认IBRION=-1,不做弛豫。

Q3

进行取代掺杂计算的时候顺序是什么?

先优化单胞,然后根据掺杂浓度确认超胞大小,建模扩超胞,优化超胞,最后再优化好的超胞基础上进行取代掺杂,创建出不同的掺杂模型,再进行掺杂模型的优化及电子性质计算。

MedeA中的掺杂模型创建工具包含Find Empty Space(间隙掺杂)、Substitution Search(取代掺杂)、Random Substitutions(随机取代掺杂)。

Q4

计算能带时,对建立了超晶胞的模型或者是掺杂了其他元素的模型里,在手动设置K点路径的时候要怎么设置?应该按照最初的晶胞设置还是另做修改呢?

如果扩成超胞或掺杂之后对称性发生变化的话,是需要重新更改高对称点的路径,MedeA中会自动根据您的模型给出相应的高对称点路径,您也可以参考相关文献,自行设置。

Q5

使用的是VASP5.4版本,赝势库里没有Cs的标准赝势文件,但是有Cs_sv和Cs_sv_GW形式的赝势文件。想请问一下,这些与标准赝势的区别?另外,也想问赝势文件的作用?

1、 用Cs_sv就可以。sv表示增加了s的半芯态,对Cs应该是增设了5s态。

参考下图,来源源资科技VASP & MedeA培训班讲义:

2、赝势文件最主要的作用是提供赝原子/原子信息,用于赝势和PAW的计算。

(1)平面波程序一般必须结合赝势或PAW使用,通过均匀格点的FFT来处理矩阵元的计算,这样的均匀格点要描述原子芯这种有cusp的情形以及内层波函数快速振荡的情况都不太容易,需要很致密的网格,这对应着高的动能截断。

(2)赝势文件的赝原子信息也同时提供了原子的密度用来做初猜、布居分析时候投影的局域态(也可能用在DFT+U的投影态上)等。

Q6

MedeA的安装也需要提前预装Intel编译器、openmpi之类的程序么?MedeA目前支持哪些作业队列管理系统?

MedeA的安装包中已经打包了Intel的编译器和并行程序包,不需要额外安装,只需要按照操作文档采用图形界面进行安装即可。

MedeA目前支持PBS、Torque、OpenPBS、LSF、GridEngine、SLURM、LoadLeveler等队列管理系统,若无以上系统,可以自行修改配置文件用以满足您自己的队列系统。

部分问题来源于网络,如侵则删。

名人课堂“第二场锂离子电池材料计算模拟课程”将于11月16-17日开课。本次我们将邀请MedeA软件原厂Materials Design公司的科学家单子睿(Dr. Ray Shan)给大家从锂电池正负极材料,Li离子电导率,电解质和锂电池材料中的界面结构及性能角度,讲解如何采用VASP和MedeA软件进行建模和计算,由浅入深地分享锂离子电池材料计算的理论基础和课题思路,相信这又是一场丰盛的“知识盛宴”,欢迎大家踊跃报名参加!

点击下图查看详情:

有奖征稿持续中~

中文征稿范围:

1、 VASP/MedeA软件应用案例、使用经验总结;

2、 VASP/MedeA在专门领域中应用综述;

3、 最新的重大学术成果报道;

4、 课题组特色工作内容介绍;

5、 公司/院校/研究所招生或招聘;

6、 学术性会议通知、杂志社邀稿、论文美化等;

投稿通道:

联系人:包怡雯

电话:15106252566(同微信)

E-mail:support@tri-ibiotech.com.cn

标准稿费300元整,若阅读量超过800、1000、2000则追加稿费(详情请联系负责人)

欢迎各位小主踊跃投稿!

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