数据科学| 蛋白向量分析
Exploring protein vector embeddings
导入库
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn import manifold
from sklearn.metrics.pairwise import cosine_distances
from sklearn.metrics.pairwise import euclidean_distances
%matplotlib inline
载入数据
gpcrs = pd.read_csv("GPCRs_vec.csv")
ion_channels = pd.read_csv("ion_channels_vec.csv")
kinases = pd.read_csv("kinases_vec.csv")
nr = pd.read_csv("Nuclear_vec.csv")
# 每个受体添加颜色
gpcrs["class"] = np.full(len(gpcrs), '#784984')
ion_channels["class"] = np.full(
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