Chemistry.AI | 基于图卷积神经网络（GCN）预测分子性质

GCN: Graph Convolutional Network(图卷积网络)

环境准备

Python版本：Python 3.6.8
PyTorch版本：PyTorch1.1.0
RDKit版本：RDKit 2020.03.1

基于图卷积神经网络（GCN）预测分子性质

导入库

from rdkit import Chem
from rdkit.Chem.Crippen import MolLogP
import numpy as np
import torch
import time

载入数据

max_natoms = 50
with open('smiles.txt') as f:smiles = f.readlines()[:]smiles = [s.strip() for s in smiles]smiles = [s.split()[1] for s in smiles]smiles = [s for s in smiles[:30000] if Chem.MolFromSmil

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