在线作图|如何画韦恩图（包含upset图）

韦恩图（包含upset图）

韦恩图（Venn diagram）用于展示在不同的事物群组（集合）之间的联系。R 语言中的维恩图绘制有很多包，Vennerable（最多9维），VennDigram（最多5维），venn（最多7维），而UpSetR绘制的维恩图则更多，只是表现形式和其他图不太一样。以upset图动态统计并展示集合间共有/特有元素信息。统计样品之间的共有、特有元素。应用范围：适用于微生物、转录组、代谢组、单细胞等组学。如分析组间共有、特有物种；分析各比较组显著差异的共有、特有pathway/基因等。

TUTU网站工具使用

小编给大家介绍一个在线作图工具，绘制韦恩图的方法如下：
登录网址：www.cloudtutu.com（推荐使用360或者谷歌浏览器）

01 登录测试账号；

网页会自动出现账号与密码；
输入验证码，登录即可，点击基本绘图。

02 找到“venn”；

03 接下来，上传文件：
a）准备一个数据矩阵（如微生物物种丰度表、环境因子表、基因表达量矩阵、代谢物含量等）；
b）表格需要带表头和列名，第一列为元素名，第一行为样品名，例如OTU，基因ID、代谢物名称等。c）请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv格式的表格文件。操作方法为：全选excel中的所有内容（ctrl+A），复制到记事本中，将记事本文件另存后上传该文件。

04 参数设置：

4.1 绘图类型：venn：样品个数少于5个推荐使用venn图；

Flower：样品个数≥6个，推荐使用花瓣图，只能显示共有和特有的元素个数；

Upset：可以很好地展示多个集合之间的共有特有元素。

4.2 字体大小：venn图中数字和字母的大小

4.3 颜色选择：对作韦恩图用的颜色进行选择。Venn图只能选择5种颜色，花瓣图随机分配。

4.4 筛选样本：对上传的表格中的样品筛选后显示在图片中（如无需要可以不填）。

4.5 筛选显示种类：选择显示的元素或样本（如无需要可以不填）。

05 下载文件：

点击“运行”开始作图，点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。

06 作图后处理：

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图，可通过矢量图处理软件进行编辑和调整（如：文字字体，文字大小，图片分辨率等）。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。

写作建议

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