WEKA-Instances-从内存中创建数据集

废话不多说，直接上干货

weka的官方参考手册：https://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/documentation.html

在API 一节中有 creating datasets in memory （官网的还是比较标准的）

大家也可以简单的看一下我写的一个简单的demo。

首先看Attribute：这个是我自己写的一个2-mer特征提取的代码大家参考形式就行；

public ArrayList<Attribute> attributes() {ArrayList<Attribute> attributes = new ArrayList<>();attributes.add(new Attribute("aa"));attributes.add(new Attribute("ag"));attributes.add(new Attribute("ac"));attributes.add(new Attribute("at"));attributes.add(new Attribute("ga"));attributes.add(new Attribute("gg"));attributes.add(new Attribute("gc"));attributes.add(new Attribute("gt"));attributes.add(new Attribute("ca"));attributes.add(new Attribute("cg"));attributes.add(new Attribute("cc"));attributes.add(new Attribute("ct"));attributes.add(new Attribute("ta"));attributes.add(new Attribute("tg"));attributes.add(new Attribute("tc"));attributes.add(new Attribute("tt"));ArrayList<String> labels = new ArrayList<String>();labels.add("1");labels.add("-1");attributes.add(new Attribute("class", labels));return attributes;}

紧接着就是Instances和Instance的创建：

需要说明的是下面代码里面的a[1]是标签（对应自己的标签就行）

public Instances atgc1(Instances data) {ArrayList<Attribute> l = attributes();Instances instances = new Instances("DNA", l, 0);instances.setClassIndex(instances.numAttributes() - 1);int sum = data.numInstances();String line;for (int i = 0; i < sum; i++) {double num[] = new double[instances.numAttributes()];Instance instance = new DenseInstance(1, num);line = String.valueOf(data.instance(i));if (line.trim().length() != 0) {String[] a = line.split(",");num[0] = stringCount(a[0], "aa");num[1] = stringCount(a[0], "ag");num[2] = stringCount(a[0], "ac");num[3] = stringCount(a[0], "at");num[4] = stringCount(a[0], "ga");num[5] = stringCount(a[0], "gg");num[6] = stringCount(a[0], "gc");num[7] = stringCount(a[0], "gt");num[8] = stringCount(a[0], "ca");num[9] = stringCount(a[0], "cg");num[10] = stringCount(a[0], "cc");num[11] = stringCount(a[0], "ct");num[12] = stringCount(a[0], "ta");num[13] = stringCount(a[0], "tg");num[14] = stringCount(a[0], "tc");num[15] = stringCount(a[0], "tt");num[16] = instances.attribute(16).indexOfValue(a[1]);}instances.add(instance);}return instances;}

在这之前也参考了网上好多网友写法，记不住链接了；大家也可以参考：

numeric：数值型，连续变量

```
Attribute date=new Attribute("aa");
```
date：日期型，日期变量

Attribute date=new Attribute("attribute_name","yyyy-MM-dd");

nominal：标称型，预定义的标签

ArrayList<String> labels=new ArrayList<String>();labels.add("label_a");labels.add("label_b");Attribute nominal=new Attribute("attribute_name",labels);

string：字符串型，文本数据

Attribute string = new Attribute("attribute_name",(ArrayList<String>)null);

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