非root用户安装Anaconda3 + setuptools + phonopy模块
本人新手,记一次计算机集群上,非root用户安装Anaconda3 + setuptools + phonopy模块
学校的超算中心在使用vasp计算声子谱的时候,没有安装phonopy模块。使用anaconda环境的python3.6编译安装phonopy时,又缺少了一个依赖库(经查询是setuptools的问题,但是已安装,具体原因不得而知)。本人非root,干脆在自己的/home下安装了最新的anaconda3和setuptools,最后成功安装phonopy。
1.安装Anaconda3。详情参阅:https://www.jianshu.com/p/b7d1612701c7
2.输入 : conda activate ,进入 conda 的环境,准备安装 setuptools 包。最新的setuptools文件已从官网https://pypi.org/project/setuptools/ 下载并上传至家目录。
在setuptools.whl文件所在的目录下,输入:
pip install setuptools.xxxx.whl (其中xxxx为版本号)。
安装成功进行下一步。
4.依旧在conda环境下,进入phonopy所在的目录,输入:
python setup.py install
等待几分钟后,安装成功。进入phono目录,输入phonopy命令,查看是否出现了下图:出现即安装成功。
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