2020-12-16 垂死挣扎
orthofinder可视化
根据orthofinder结果中的单拷贝直系同源基因建树
我的博客针对不同基因集(Group)所包含的全部基因提取其蛋白序列,进行COG与KEGG功能注释,阈值 E-value≤1e-5
COG功能归类与富集,KEGG代谢通路分类和富集,阈值 FDR≤0.001
对富集在某功能类别的基因数量 10 以下的 COG和 KEGG 条目忽略不计
以全基因组的 COG和 KEGG富集到每个功能条目的比例作为平均分布水平,将不同基因集富集结果与平均分布水平进行比较&#x
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