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编者按
工欲善其事,必先利其器。作为生物信息分析人员,每天都需要通过SSH工具远程登录服务器,那么使用一款高效的连接工具就很有必要。这次我们来点评一下几款常用的SSH登录工具。其实类似的工具还有很多,这里只拿几款常用的作为介绍。

我对一款好用的工具主要需要满足以下几点。
1、连接服务器快速,稳定;
2、支持sftp或者ftp文件传输;
3、支持X11;
4、美观;
根据这几个特点,我们就来点评几款工具。

自带终端模

苹果的Mac系统和原生Linux系统自带终端模拟器,可以通过ssh命令直接登录服务器。自带终端的好处是,可以直接在命令行进行登录,无需额外安装软件。同样可以使用scp,sz,rz等命令进行文件的传输。苹果电脑自带的终端字体也比较漂亮,也可以进行各种设置,包括背景色,透明度等。还是比较好用的。

ssh wangtong@123.tongyuangene.com:22
scp -r upload wangtong@123.tongyuangene.com:/home/wangtong
scp -r wangtong@123.tongyuangene.com:/home/wangtong/download ./

Putty

putty是最简单的SSH工具,无需安装,支持多系统版本,下载后就可以直接使用,是我刚刚接触生物信息时使用的工具,而且用了两年多。
网址:https://www.putty.org/https://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/
缺点:
1、不支持标签模式;
2、默认设置不友好,很多功能都需要额外配置才行,例如自动登录功能;
3、不能传输文件;
4、没有X11,需要配置Xming工具;
5、默认keepalives没有设置,一段时间不操作后会断开。

XManager

Xmanager是一个工具集合,里面包括了xshell,xftp,xbrowser,xstart,xlpd等等功能,其中最常用的就是xshell和xftp,我个人认为xshell是最好用的ssh工具,这也是我目前每天使用的工具。

网址:http://www.netsarang.com/products/xmg_detail.html
优点:xshell的优点特别多。除了弥补了putty上面所有的缺点之外。xshell的设计简洁,支持多标签模式,默认可以进行自动登录,方便进行快速设置主题,字体等,可以一键连接xftp工具。
缺点:
1、收费(home and school users可以申请免费使用xshell与xftp)
2、只有windows版本。

SSH Secure Shell Client

用过几次,没觉得有什么特殊的功能,也是同时支持ssh和sftp连接,感觉界面比较丑陋,而且比较乱,就放弃使用了。
网址:https://www.ssh.com/ssh/

secureCRT

SecureCRT也是一款功能强大的工具,比较好用。但是也是收费的(钱不是白收的),同时支持windows,mac,linux,iOS等多系统平台。是mac用户的首选。SecureCRT除了包括一般工具都有的特点之外,还包括自动注册、对不同主机保持不同的特性、打印功能、颜色设置、可变屏幕尺寸、用户定义的键位图等等功能。
网址:https://www.vandyke.com/products/securecrt/

Mobaxterm

Mobaxterm也是我推荐给别人使用的一款工具,如果不想购买付费购买Xmanager,mobaxterm是一个很好的替代。
mobaxterm的功能非常非常多,几乎提供了所有重要的远程网络工具(如SSH、X11、RDP、VNC、FTP、MOSH等),以及Windows 桌面上的Unix命令(bash、ls、cat、sed、grep、awk、rsync等),登录之后默认开启sftp模式。虽然功能比较大,但同时增加了学习成本。我制作过专门的视频全面讲解mobaxterm。其实对绝大部分用户来说根本用不到太多功能。
生信工作者的神器——MobaXterm
:https://ke.qq.com/course/297547?tuin=1c7ef510

生物信息工作者的神器——mobaxterm

缺点:只支持windows系统。

Rstudio

最后,在给大家介绍一下Rstudio和Rstudio-server的新功能。现在的Rstudio能都连接本地终端,如果是在服务器端,就可以登录服务器。也就是不需要任何工具,只在任何浏览器中登录Rstudio-server,就可以直接连接服务器,非常方便。它的优势不言自明,无需携带安装你熟悉的工具,只需要通过浏览器登录既可访问服务器。

以上就是我们比较的一些SSH工具,类似的工具还有很多很多,例如Bitvise SSH Client、DameWare SSH、marTTY、Cygwin,finalshell等。选择自己顺手的工具就行。你的生物信息分析能力与使用什么工具多大关系。

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