看过都说好系列

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集）等内容。

继人类基因组计划（Human Genome Project）之后，人类细胞图谱计划（Human Cell Atlas，HCA）直指更远大的目标：表征一切人体细胞，覆盖所有组织和器官，描绘健康人体的细胞参考地图。HCA将提供不同类型细胞组成人体组织的3D图谱、所有人体系统的通讯方式，以及图谱变化与健康和疾病的关系。未来，HCA将彻底改善临床医生和研究人员对疾病的理解、诊断和治疗。

应用一：发现未知的细胞类型

利用单细胞基因组学技术，研究人员发现了罕见细胞类型并命名为“肺离子细胞（pulmonary ionocyte）”。令人意外的是，这类细胞中的CFTR基因表达水平比其他任何细胞类型都高，如果该基因发生突变，就会导致人类囊性纤维化。CFTR对气管的功能至关重要，几十年来，研究学者和临床医生都知道，它们在纤毛细胞中存在低量表达。但最新数据却告诉我们，CFTR竟然一直“悄悄地”在特定类型的细胞中大量表达，这将改变了我们对囊性纤维化和哮喘等肺病的认识。

应用二：确定细胞分化的顺序

利用单细胞基因组学技术，科研人员追踪了斑马鱼发育过程中心脏、神经和血细胞的发育过程，包含了约4万个单细胞分析的结果，完整重建了斑马鱼配胚胎发育过程中单个细胞的发育轨迹，在发育生物学中具有里程碑意义。

应用三：识别细胞使用的程序

利用单细胞基因组学技术，研究人员鉴定出恶性肿瘤细胞中存在的一种免疫抵抗性程序，多种免疫抵抗性机制在这种免疫抵抗性程序中受到共同调节，而且这种免疫抵抗性程序可预测黑色素瘤患者对免疫治疗作出的反应，此外，CDK4/6抑制剂可抑制这种免疫抵抗性程序，从而可能让黑色素瘤对免疫治疗变得敏感。

应用四：了解复杂疾病的发病机理并指导疾病治疗

利用单细胞基因组学技术，研究人员揭示了特定风险基因所对应的细胞种类和信号通路。这项工作不仅鉴定出在溃疡性结肠炎这个疾病模型中一些已知的风险基因在不同细胞类型和信号通路的分布，同时为今后利用单细胞基因组学技术去寻找疾病的成因以及治疗方法提供了一个很好的技术框架。

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细胞作为生命活动最为基本的单元，是所有生命活动的基石。自从虎克发明显微镜以来，生物学家在各种显微镜-从普通光学显微镜到最近的超分辨显微镜等条件下工作了已经近180年，但对细胞的认知仍一知半解。

近年来，随着单细胞分离技术和高通量测序技术的不断发展，已经可以在单细胞水平上鉴定DAN突变、RNA转录物、蛋白质、染色质开放性和其它细胞成分等，为系统解码单细胞功能图谱以及调控网络带来了机遇。

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