1. 配置NDK路径设置

可以在cygwin中通过vim修改，也可以在windows安装目录中修改 home\<你的用户名>\.bash_profile 文件中最后添加环境变量

NDK=/cygdrive/e/Andriod/develop/android-ndk-r4

export PATH=$PATH:$NDK

其中NDK=/cygdrive/<你的盘符>/<android ndk 目录> ，"NDK"这个名字随便起，以后经常用不要太长。

重启cygwin，输入：

cd $NDK

可进入ndk对应目录说明设置OK。

2. JNI编译环境配置

工程右键，点Properties->C/C++ Build的Building Settings中去掉Use default build command，然后输入${NDKROOT}/ndk-build.cmd

在C/C++ Build中点击Environment，点Add...添加环境变量NDKROOT，值为NDK的根目录 E:\android\develop\android-ndk-r10d

3. 出现的提示信息如下：

Multiple markers at this line
  - Syntax error
  - Type 'JNIEnv' could not be resolved
  - Type 'JNICALL' could not be resolved

是由于没有将jni.h导入的缘故，而这个文件在ndk的目录下面。所以，参照以下步骤：
Project Properties -> C/C++ General -> Path and Symbols
选择include标签，Add -> E:\android_sw\android-ndk-r10d\platforms\android-19\arch-arm\usr\include
且选中All languages.最后Apply -> OK 这样错误就解决了。

4. 报错：Program "sh" not found in PATH

C:\cygwin64\bin目录添加到win7系统的path环境变量中。

5. Android NDK: Your Android application project path contains spaces: 'E:/ ./ (x86)/' 

Android NDK: The Android NDK build cannot work here. Please move your project to a different location.
E:\android\android-ndk-r10d\build/core/build-local.mk:155: *** Android NDK: Aborting. . Stop.

新建并配置一个Builder
 （1）点击Project->Properties->Builders->New，新建立一个Builder。在弹出的对话框上面点击Program,OK！如图四所示：

（图四）
（2）在弹出的对话框【Edit Configuration】中，配置选项卡【Main】：
      Location中需要填入nkd-build.cmd的路径（NDK安装目录下）。
      Working Diretcoty中需要填入TestNDK的工程根目录。
       如图五所示：

（图五）
（3）配置选项卡【Refresh】，如图六所示：
      勾选“Refresh resources upon completion”，
      勾选“The entire workspace”，
      勾选“Recuresively include sub-folders”。

(图六)
（4）配置选项卡【Build Options】，如图七所示：
      勾选“After a “Clean””，
      勾选“During manual builds”，
      勾选“During auto builds”,
      勾选“Specify working set of relevant resources”。
      点击“Specify Resources…”勾选TestNDK工程的“jni“目录 ，Finish！

保存设置，OK！

（图七）

（5）Project->clean->选择工程->点击OK。当在console里面看到如图八所示的信息，则表示一切正常,此时就已经是自动编译代码了。

 6. 自己测试的 eclipse ndk 工程设置，该工程还作为library，被其他工程调用

设置完之后，选择eclipse的Project->clean...，则先clean工程，再运行该Builder，调用ndk-build.cmd编译jni代码。

详细的设置如下图所示：

别的工程引用该library，开发时需要查看该library的源码，只要将该library源码和该工程进行关联即可。如下所示：