安装分子对接软件UCSF DOCK6

1. UCSF DOCK6简介

UCSF DOCK是一款十分经典的分子对接软件，主要目的是解决分子相互“对接”的问题。一般来说，“对接”是在已知结构的大分子（受体）的活性位点内识别小分子（配体）能量最低的结合模式。一种与疾病相关的受体相互结合的化合物，可能抑制该受体的功能，从而起到发挥药效的作用。对接得到的结果有两个：1. 通过有效的打分方程计算尽可能精确的结合能量；2. 通过有效的算法来搜索潜在的结合模式。
从最初的DOCK使用几何匹配算法进行刚性对接到DOCK6增加了一些重要功能，提高了算法找到最低能量结合模式的能力，包括基于力场的评分、动态优化、改进的刚性对接匹配算法和柔性配体对接算法。有关DOCK过去版本的更多信息，请单击此处。

2. UCSF DOCK6下载

UCSF DOCK6下载需要非商业邮箱申请，一般是@edu.cn即可申请该软件的下载许可。

3. UCSF DOCK6安装

安装步骤

tar -xzvf dock.6.9_linux.tar.gz
cd dock6/
cd install/
./configure gnu
make all

修改环境变量~/.bashrc

#UCSF DOCK6
export PATH=/home/murphystar/software/dock6/bin:$PATH

source下当前shell

. ~/.bashrc

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