python实现求解最长公共子序列LCS问题

在实现论文《Automatically Generating Models for Botnet Detection》论文的算法中，用到了一个The longest commom subsequence algorithm算法，就是最长公共子序列LCS问题。求两个字符串的最长公共子串，这个子串不要求在两个字符串中连续，但是要有序。

个人感觉写的比较好的博客：http://blog.chinaunix.net/uid-26548237-id-3374211.html

算法如下：

1、序列str1和序列str2

·长度分别为m和n；

·创建1个二维数组L[m.n]；

·初始化L数组内容为0

·m和n分别从0开始，m++，n++循环：

- 如果str1[m] == str2[n]，则L[m,n] = L[m - 1, n -1] + 1；

- 如果str1[m] != str2[n]，则L[m,n] = max{L[m,n - 1]，L[m - 1, n]}

·最后在L[m,n]中的数字一定是最大的，且这个数字就是最长公共子序列的长度

·从数组L中找出一个最长的公共子序列

2、从数组L中查找一个最长的公共子序列

i和j分别从m，n开始，递减循环直到i = 0，j = 0。其中，m和n分别为两个串的长度。

·如果str1[i] == str2[j]，则将str[i]字符插入到子序列内，i--，j--；

·如果str1[i] != str[j]，则比较L[i,j-1]与L[i-1,j]，L[i,j-1]大，则j--，否则i--；（如果相等，则任选一个）

python实现：http://blog.csdn.net/littlethunder/article/details/25637173

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