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老师们筛选到自己感兴趣的基因之后是否会有如下需求和疑问：

1、这些基因主要的生物功能是什么？

2、这些基因主要涉及什么信号通路？

3、怎么绘制精美的富集统计图？

4、怎么查看这些基因在通路图中的信息？

本文通过介绍欧易在线富集分析工具

(https://cloud.oebiotech.cn/task/array_enrichment/)为大家一次性解决如上问题，准备好您的基因列表，轻点鼠标“选择文件”—“提交”，便可轻松获得富集分析打包结果(包含：富集统计结果、富集条形图、气泡图、网页报告......)啦！

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GO和KEGG基本概念

在介绍小工具之前，先跟大家简单分享一下GO和KEGG的基本概念。

Gene Ontology(GO)数据库^[1][2]提供了专业的术语来定义基因产物的属性。它包含三大类：生物学过程(Biological Process，BP)；细胞组分(Cellular Component，CC)；分子功能(Molecular Function，MF)。GO富集分析对目标基因进行GO分析，从而对这个基因的功能进行描述。

Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)是系统分析基因功能、联系基因组信息和功能信息的数据库。KEGG富集分析利用KEGG数据对目标基因进行Pathway分析，可以获取目标基因显著相关的Pathway，从而推断目标基因集合可能和哪些Pathway的改变有关。

接下来我们正式进入干货时间……

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在线富集分析操作步骤

通过传送门进入分析界面

https://cloud.oebiotech.cn/task/array_enrichment/

Step1: 上传基因表格

上传的表格文件格式可以是txt、xls、xlsx和csv中的任何一种，其添加数据类型有如下两个形式

- 两种表格形式 -

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Step2:物种选择

(1)人，大鼠，小鼠物种选择

只需选择对应物种名称

(2)其它物种选择

需上传对应物种富集背景文件(老师们如果是在欧易做的项目，都会免费提供该文件哟，欢迎联系索取！)

Step3: 提交任务

添加“提交”后即可等待结果的输出，结果为zip压缩文件，解压即可得到全部富集分析内容

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富集分析结果查看

输出文件结构图：

1、GO 结果

打开“GO_Enrichment”文件夹，可以看到一份html的网页报告，报告内容分如下三部分。

第一部分：GO分析概述

第二部分：GO图形结果展示

第三部分：GO结果表格数据

2、KEGG结果

打开“KEGG_Enrichment”文件夹，可以获取一份html网页报告，报告内容分如下三部分。

第一部分：KEGG分析概述

第二部分：KEGG图形结果展示

第三部分：KEGG结果表格数据

以上就是我们欧易在线富集分析小工具的操作步骤和结果查看说明，欢迎各位老师前往尝试(https://cloud.oebiotech.cn/task/array_enrichment/)，体验自己动手分析数据的快乐~~

参考文献

1.Ashburner et al. Gene ontology: tool for the unification of biology. Nat Genet. May 2000;25(1):25-9. 2.The Gene Ontology Consortium. The Gene Ontology Resource: 20 years and still GOing strong. Nucleic Acids Res. Jan 2019;47(D1):D330-D338.

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欧易小强撰文本文系欧易生物原创欢迎转发到朋友圈转载请注明本文转自欧易生物

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