关于RNA-seq数据集的小结

关于数据集的小节：

1、reads：测序得到的小片段（类似：ATCCTA..GCTA）
2、counts：与已知序列（基因）比对上的reads个数（为整数，可能是个位数也可能是几千，与基因表达情况和测序深度有关）
3、由于不同基因的reads长度不同，从统计角度上看，需要采用FPKM或RPKM来排除随机抽样带来的偏倚。并且，不同的测序深度，直接影响counts的个数。
4、通常，如果数据集都为整数，基本上可以判定是counts值，如果是小数，基本上可以判定是做整理后的FPKM或RPKM，这个就需要找到数据集的源头（NCBI或其它数据库）查看数据的说明

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