graphpad做折线图_GraphPad 折线图要这样玩
折线图是科研文献中最常见的统计图之一,选择作折线图的数据都具有如下特征:同一事物在时间上具有连续性。例如,上图中的折线图,可以看出是两组动物(Ctrl 和 CUMS 造模组)随着时间变化(0~8 week)相对应行为学指标的变化。
值得注意的是两组或多组之间某个指标的比较不用折线图,下图是一篇 SCI 文献中的折线图,表示的是不同组之间的 Memory score(% of cont),此时表现为折线图是不够明智的,应该用柱状图或者箱形图表现。
接下来,我将演绎如何绘制好看的折线图。已知 Mean、SD、N 绘制折线图
SD 或者 SEM 可由 Excel 表格计算得出,计算公式为标准差 SD = STDEV.S(需要计算的数据列),标准误 SEM = SD/SQRT(N)
已经计算好的数据如下:
Step 1打开 GraphPad Prism5.0 软件,选择 XY, 选择 Points & connecting line(点加连线),选择已知 Mean,SD,N 作图,Create。
Step 2输入数据,在 Graphs 下可以看见刚刚输入的数据 Data1
进行相应美化后,导出图片(tiff,dpi = 600)即可。双击图片弹出 Format Graph 菜单,可对折线图进行设置。
例如在 Style 菜单下可以选择显示误差棒,在本图中我们可以选择只显示均值/均值和误差棒。还可以设置显示的标志(Show symbols)的颜色、大小和形状。
对于误差棒的显示可以选择显示 Error bars 的颜色,Error bars 的方向:Above 朝上,Below 朝下,Both 两边均有。
Style 有几种不同的风格,可以根据自己的要求更改。注意的是,最好在同一篇文章里面做到一致。最后 Thickness 可以更改误差线的厚度(以上操作非常简单在此不放示例图片)。
在 Show area fill 设置下可以选择进行面积填充。比如在此选择填充颜色为粉红色,Position 为至 X 轴,效果如下图。
原始数据绘制折线图
此时的原始数据格式如下:
Step 1打开 GraphPad Prism5.0 软件,选择 XY, 选择 Points & connecting line(点加连线),选择 Y,Enter 11……and plot Mean and Error, SEM(SD),Create。
Step 2输入数据,在 Graphs 下可以看见刚刚输入的数据 Data1
进行相应美化后,导出图片即可。
对于 * 号的添加,在 Write 菜单下 T 文本工具,添加 * 即可。
有一个问题就是两条折线图相隔很近有重复,又想看清两条折线图,此时需要双击任意数据点打开 Format Graph 对话框。
选择 Data sets on Graph 一栏中的底端选项,对一个数据组进行微调。对每个 X 和 Y 进行特定值微调,应谨慎使用此功能,因为这意味着在图上的标志的位置和数据点真实的 X 和 Y 值不匹配。
答疑时间
文献中的柱状图 NT 对照组与三个处理组的间距最大,三个处理组的间距小一些,这样能够更好的区分对照组和实验组。使用 GraphPad Prism 5.0 达到这种第一根柱子和后面柱子间距不一样的图呢?
上面的柱状图是随意输入几个数据得到的柱状图,双击图片,打开 Format Graph 对话框。选择 Data sets on Graph 一栏中的底端选项,对一个数据组进行微调。调节 A、B 之间的距离由 100% 改为 200%,OK,即可得到文献中的效果。此操作与前面所述的移动重叠的图片操作类似。
大家课后可以自己绘制柱状图后进行练习。
想要跃跃欲试的小伙伴,直接回复口令 17,拿练习包自己操练起来吧!
老规矩,图片不清楚的小伙伴可以看下面视频(温馨提示:视频时长 6 分钟)
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