Tensorflow2.0数据和部署(三)——基于Tensorflow数据服务的数据管道
文章目录
- 一、概述
- 1.概述
- 2.TFDS功能介绍
- (1)ETL原理
- (2)Datasetinfo
- (3)load参数说明
- 二、split和slice
- 1.Split API
- (1)Legacy API(不建议使用)
- (2)S3 API
- 2.TFRecord
- 三、数据pipeline
- 1.tf.data.Dataset
- 2.数据类型
- 3.数据源
- (1)numpy、pandas、images
- (2)csv
- (3)txt、TFRecord
- (4)generator
- 四、性能
- 1.提升性能的方法
- (1)缓存
- (2)并行API
- (3)运行顺序
一、概述
1.概述
从整体上看,数据可分为六种类型:图像、语言、结构化数据、视频、文本、翻译。目前来讲,对于在深度学习领域使用的数据有以下问题:
- 不同来源的数据格式差距很大
- 数据在下载之前不知道大小
- 需要转换数据使其易于可用
Tensorflow Dataset(TFDS)能够与Tensorflow训练衔接,使用灵活
Tensorflow Dataset(TFDS)能够与Tensorflow训练衔接,使用灵活,下面是TFDS中包含的一些数据集。
2.TFDS功能介绍
(1)ETL原理
数据pipeline基于ETL原理工作,ETL是指抽取(extract)、转换(transform)、加载(load)
# EXTRACT
dataset = tfds.load(name="mnist", split="train")# TRANSFORM
dataset = dataset.shuffle(100)
dataset = dataset.repeat(NUM_EPOCHS)
dataset = dataset.map(lambda x:...)
dataset = dataset,batch(BATCH_SIZE)# LOAD
for data in dataset.take(1):image = data["image"].numpy().squeeze()label = data["label"].numpy()print("Label: {}".format(label))plt.imshow(image, cmap=plt.cm.binary)plt.show()
# 查看所有的数据集
print(tfds.list_builders())
(2)Datasetinfo
查看TFDS的元数据使用Datasetinfo类,在load函数中设置with_info为True,并用一个变量来接受info内容。
(3)load参数说明
数据集版本:数据集后面的三个数字分别表示主要版本、次要版本、补丁版本
minst = tfds.load("mnist:1.*.*")
as_supervised:设为False返回字典表示的数据,设置为True返回元组表示的数据
split:根据创建者的设定,split参数可取的值包括tfds.Split.TRAIN、tfds.Split.VALIDATION、tfds.Split.TEST、tfds.Split.ALL。也可以使用一些自定义的split声明,具体内容见下一小节。
二、split和slice
1.Split API
Split API分为两种,第一种是Legacy tfds.Split API,第二种是Splits API(S3),后者为默认方法。
(1)Legacy API(不建议使用)
目前,Legacy API提供了许多灵活的交互方式以及某些复杂的切片操作。
Merging
使用加号来合并所需要的的部分all = tfds.Split.TRAIN + tfds.Split.TEST ds = tfds.load("mnist", split=all)
Subsplit:将现有拆分进一步划分为更多部分
s1, s2, s3 = tfds.Split.TRAIN.subslpit(k=3) data1 = tfds.load("mnist", split=s1) data2 = tfds.load("mnist", split=s2) data3 = tfds.load("mnist", split=s3)
加权分割
half, quarter1, quarter2 = tfds.Split.TRAIN.subslpit(weighted=[2,1,1])
Slicing:通过指定百分比切片来对数据集进行切片
first_30_percent = tfds.Split.TRAIN.subslpit(tfds.percent[:30])
Composition:将不同部分组合到一起
first_50_train = tfds.Split.TRAIN.subslpit(tfds.percent[:50]) split = first_50_train + tfds.Split.TEST data = tfds.load("mnist", split=split)
注意事项:
- 不能多次添加同一部分,例如Train+Train
- 不能在subsplit后再次subsplit
- 不能在已经merge的数据集中进行subsplit
(2)S3 API
使用字符串文字来决定拆分
split = "train+test"
split = "train[:300]"
split = "train[:30%]"
split = "train[-30%:]"
split = "train[-30%:]+train[:10%]"
使用之前确保数据集能够支持。
K折划分
val_ds = tfds.load('mnist:3.*.*', split=['train[{}%:{}%]'.format(k, k+20) for k in range(0,100,20)])train_dx = tfds.load('mnist:3.*.*', split=['train[:{}%]+train[{}%:]'.format(k, k+20) for k in range(0,100,20)])
2.TFRecord
在使用tfds.load
加载数据集后,会下载对应的数据文件,其格式为xxx_train.tfrecord-xxxxx。我们可以通过tfrecord来获取原始文件信息。
import tensorflow as tf
import tensorflow_datasets as tfds
data, info = tfds.load("mnist", with_info=True)
输出其中一个文件,可以看到以16进制存储的文件
filename="/root/tensorflow_datasets/mnist/3.0.0/mnist-test.tfrecord-00000-of-00001"
raw_dataset = tf.data.TFRecordDataset(filename)
for raw_record in raw_dataset.take(1):print(repr(raw_record))
将16进制文件进行解码得到适当的格式
# Create a description of the features.
feature_description = {'image': tf.io.FixedLenFeature([], dtype=tf.string),'label': tf.io.FixedLenFeature([], dtype=tf.int64),
}def _parse_function(example_proto):# Parse the input `tf.Example` proto using the dictionary above.return tf.io.parse_single_example(example_proto, feature_description)parsed_dataset = raw_dataset.map(_parse_function)
for parsed_record in parsed_dataset.take(1):print((parsed_record))
三、数据pipeline
一些经典的数据集都是以浮点型数据作为输入,但是在真实数据集中也包括了很多类别型变量或者一些用数字表示但是含义不是数字本身的,使用tf.data
可以搭建简单可重用的复杂输入pipeline。而且,tf.data
能够处理大规模数据、从不同的来源读取数据和进行复杂的转换。
1.tf.data.Dataset
tf.data
API使用tf.data.Dataset
类来进行对数据的处理,例如:
从内存或其他数据源建立一个数据集,应使用
tf.data.Dataset.from_tensors()
或者tf.data.Dataset.from_tensor_slices()
,如果是以TFRecord方式存储,应使用tf.data.TFRecordDataset()
dataset = tf.data.Dataset.from_tensor_slices([8, 3, 0, 8, 2, 1])
当有了数据集对象,可以通过其中的一些方法对数据集进行转换,常见的有
Dataset.map()
和Dataset.batch()
2.数据类型
不同的数据有不同的数据类型,反应在数据集中则表现为不同的列有不同的属性,下面介绍不同种类的列:
数值型变量:最简单的数值型数据,参数可以用dtype指定类型,维度
age = tf.feature_column.numeric_column("age", dtype=tf.float64, shape=[5,10])
桶型(Bucketized)数据:数据分桶,例如小于18岁为青少年,18-50岁中年人,50岁以上老年人。首先将数据读取为数值型变量,之后设定边界将其进行数据分桶
age = tf.feature_column.numeric_column("age") age_buckets = tf.feature_column.bucketized_column(age, boundaries=[18, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65])
类别型变量
# 桶化转变为类别型 identity_feature_column = feature_column.categorical_column_with_identity(key='my_feature', num_buckets=4)# 从词表构建类别型 thal = feature_column.categorical_column_with_vocabulary_list('thal', ['fixed', 'normal', 'reversible'])# 类别较多时利用哈希表构建类别型,注意hash_bucket_size要慎重选择 thal_hashed = feature_column.categorical_column_with_hash_bucket('thal', hash_bucket_size=1000)# 交叉特征可以结合两个特征,这种方法也是基于哈希表的 crossed_feature = feature_column.crossed_column([age_buckets, thal], hash_bucket_size=1000)
Embedding变量:注意embedding维度
thal_embedding = feature_column.embedding_column(thal, dimension=8) demo(thal_embedding)
3.数据源
(1)numpy、pandas、images
读取numpy格式最常见的方法是tf.data.Dataset.from_tensor_slices
train, test = tf.keras.datasets.fashion_mnist.load_data()
images, labels = train
images = images/255dataset = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((images, labels))
读取pandas文件
titanic_file = tf.keras.utils.get_file("train.csv", "https://storage.googleapis.com/tf-datasets/titanic/train.csv")
df = pd.read_csv(titanic_file, index_col=None)
target = df.pop(['target'])
dataset = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((df.values, target.values))
读取图像文件
flowers_root = tf.keras.utils.get_file('flower_photos','https://storage.googleapis.com/download.tensorflow.org/example_images/flower_photos.tgz',untar=True)
flowers_root = pathlib.Path(flowers_root)
label_names = sorted(item.name for item in flowers_root.glob('*/') if item.is_dir())
(2)csv
csv文件是最常用的文件格式之一,可以使用tf.keras.utils.get_file
或者pd.read_csv
等方法读取
(3)txt、TFRecord
读取txt文件
directory_url = 'https://storage.googleapis.com/download.tensorflow.org/data/illiad/'
file_names = ['cowper.txt', 'derby.txt', 'butler.txt']file_paths = [tf.keras.utils.get_file(file_name, directory_url + file_name)for file_name in file_names
]
dataset = tf.data.TextLineDataset(file_paths)
# 之后对文件进行解码
dataset.decode('utf-8')
读取TFRecord
fsns_test_file = tf.keras.utils.get_file("fsns.tfrec", "https://storage.googleapis.com/download.tensorflow.org/data/fsns-20160927/testdata/fsns-00000-of-00001")
dataset = tf.data.TFRecordDataset(filenames = [fsns_test_file])
(4)generator
常用于处理图像
flowers = tf.keras.utils.get_file('flower_photos','https://storage.googleapis.com/download.tensorflow.org/example_images/flower_photos.tgz',untar=True)img_gen = tf.keras.preprocessing.image.ImageDataGenerator(rescale=1./255, rotation_range=20)
ds = tf.data.Dataset.from_generator(img_gen.flow_from_directory, args=[flowers], output_types=(tf.float32, tf.float32), output_shapes=([32,256,256,3], [32,5])
)
四、性能
1.提升性能的方法
我们知道使用GPU、TPU能够加快训练速度,但是如果没有一个很好的数据pipeline,效率也可能非常低下,尤其在并行计算的时候。
下图是前文讲的ETL原理,先从本地或者远程抽取数据,在对数据进行各种形式的转换,最后将转换后的数据送入加速器中。
在上述过程中,预处理阶段在CPU上进行,训练阶段在GPU上进行,所以可以看出预处理阶段可能会成为训练速度的瓶颈。
在现实世界中,分布式存储数据和分布式训练有着重要的作用。在没有进行pipeline时,程序按照处理——训练——处理——训练的流程进行,效率低下,经过pipeline后,程序会在训练的同时并行处理下一组数据,这样能够增加效率。
(1)缓存
缓存是一种很方便的提高性能的工具。tf.data.Dataset.cache()
转换可以在内存或本地存储中缓存数据集。
如果数据可以放入内存中,使用缓存转换可以在第一个epoch将数据缓存到内存中,这样做可以避免后续epoch读取数据的时间开销。这种转换也可以通过指定本地文件名进行缓存。
dataset = tfds.load("cats_vs_dogs", split=tfds.Split.TRAIN)# 内存中缓存
train_dataset = dataset.cache()
model.fit(train_dataset, epochs=...)# 硬盘缓存
train_dataset = dataset.cache(filename='cache')
model.fit(train_dataset, epochs=...)
(2)并行API
tf数据并行性主要有三个方面;
map:在数据转换时,转换的开销很大,可能无法充分利用CPU,例如图像数据需要进行改变大小、随机翻转、选转等操作。因此,在map函数中,可以设置参数num_parallel_calls来设定CPU核数来增加效率。
num_cores = multiprocessing.cpu_count() augmented_dataset = dataset.map(augment, num_parallel_calls=num_cores)
但是在复杂的情况下,硬件会进行虚拟化且不断变化,这会产生一些问题。因此,我们可以在运行中进行动态调整
from tensorflow.data.experimental import AUTOTUNE augmented_dataset = dataset.map(augment, num_parallel_calls=AUTOTUNE)
prefetch:从数据集中加载数据可以使用预取(prefetch)方法,预提取方法会运行一个后台线程,利用缓冲区提前从输入数据集中预取元素,预取的数据应大于等于每个训练步的batch。
augmented_dataset = dataset.map(augment, num_parallel_calls=AUTOTUNE).prefetch(tensorflow.data.experimental.AUTOTUNE)
interleave:加载数据的时候有时需要对数据进行反序列化或者解码,这些操作也会有很大的时间开销,因此我们需要减轻数据提取的开销,并行处理数据。
num_parallel_reads=4 dataset = files.interleave(tf.data.TFRecordDataset, # map functioncycle_length=num_parallel_reads,num_parallel_calls=tensorflow.data.experimental.AUTOTUNE)
(3)运行顺序
我们已经介绍了tf.data
中的很多方法,他们之间的顺序尤为重要
- map和batch:向量化处理,先进行batch后进行map
- map和cache:当转换很复杂时先map再cache
- shuffle和repeat:先repeat后shuffle会模糊边界从而性能更好,先shuffle后repeat能够保证顺序。
- interleave、prefetch、shuffle:使用对内存影响最小的顺序
Tensorflow2.0数据和部署(三)——基于Tensorflow数据服务的数据管道相关推荐
- TensorFlow2.0 学习笔记(三):卷积神经网络(CNN)
欢迎关注WX公众号:[程序员管小亮] 专栏--TensorFlow学习笔记 文章目录 欢迎关注WX公众号:[程序员管小亮] 专栏--TensorFlow学习笔记 一.神经网络的基本单位:神经元 二.卷 ...
- R语言dplyr包使用case_when函数和mutate函数生成新的数据列实战:基于单列生成新的数据列、基于多列生成新的数据列
R语言dplyr包使用case_when函数和mutate函数生成新的数据列实战:基于单列生成新的数据列.基于多列生成新的数据列 目录
- ☀️从0到1部署Hadoop☀️基于网站日志进行大数据分析【❤️建议收藏❤️】
目录 基于Hadoop部署实践对网站日志分析 1.项目概述 2.安装及部署 2.1 VMware安装 2.2 Ubuntu安装 2.3 Java环境安装 2.4 Hadoop安装 2.5 MySQL安 ...
- 个推0代码数据可视化实操 | 基于Tableau的中国奥运数据探索
8月8日,东京奥运会正式落下帷幕.经过17天的激烈角逐,中国代表团在本届奥运会上共斩获38金32银18铜,位居奖牌榜第二,追平了在伦敦奥运会取得的境外参赛最好成绩. 奥运会期间,奖牌榜上的每一次变动都 ...
- 无处不数据的时代 三大运营商如何变现大数据价值?
5月18日消息,昨天是世界电信日,其主题是"发展大数据,扩大影响力". 其实我们已经处在了无处不数据的时代,但大数据的发展才刚刚开始,城市中的数据利用率仅为0.4%,且大部分数据还 ...
- A.2【数据标注】:基于Label studio的训练数据标注指南:信息抽取(实体关系抽取)、文本分类等
NLP专栏简介:数据增强.智能标注.意图识别算法|多分类算法.文本信息抽取.多模态信息抽取.可解释性分析.性能调优.模型压缩算法等 专栏详细介绍:NLP专栏简介:数据增强.智能标注.意图识别算法|多分 ...
- 国内跨云端平台应用的大数据平台供应商,基于Hadoop的互联网大数据平台解决方案,武汉数道云...
跨云端大数据平台是什么?有何实质性的价值呢?如何去实现跨云端大数据平台技术呢?这是耐人深思的话题. 高速发展的信息技术,不断扩张的数据库容量,互联网作为信息传播和再生的平台,"信息泛滥&qu ...
- 基于linux的netfilter处理数据包的过程分析,基于Linux的Netfilter处理数据包的过程分析...
基于Linux的Netfilter处理数据包的过程分析 防火墙技术在保护网络安全方面的作用越来越明显.相比较window,Linux有更好的网络性能,因此基于Linux的Netfilter技术 (本文 ...
- python实现图的数据存储_Neo4j推出基于Python的嵌入式图数据存储
龙源期刊网 http://www.qikan.com.cn Neo4j 推出基于 Python 的嵌入式图数据存 储 作者:
- 导入数据中文乱码_基于Navicat和Kettle的数据迁移完全解读(多图)
需求描述 对于数据分析人员来说,工作的基础是数据,没有数据分析就无从谈起,即巧妇难为无米之炊. #数据库# #数据迁移# #Oracle# 然而,数据分析往往在实验环境或者准生产环境中开展,而数据分布 ...
最新文章
- Linq延迟求值现象
- 前端性能调优之Yahoo--23条
- 20170204-py
- ------shell学习
- 腾讯Node.js基础设施TSW正式开源
- 两个数相乘积一定比每个因数都大_小升初数学知识点大全含公式+20类必考应用题(含答案解析),孩子考试一定用得上!...
- git多项目管理模式_Git十年,一项开放商业模式倡议以及更多新闻
- linux的进程/线程/协程系列5:协程的发展复兴与实现现状
- 程序员专属段子集锦 6/10
- 如何使用大数据算法改善有效链接
- hexo和github pages的关系
- 2020你一直在苦找的Ps插件全在这!20款Photoshop实用插件分享
- google hacking搜索语法总结
- TFT液晶屏显示原理
- ARM架构(RISC)和x86架构(CISC)以及传统与移动CPU/GPU厂商
- 计组-流水线(三张图解决流水线概念计算吞吐率)
- 智能车|直流电机、编码器与驱动器
- Gitlab统计代码的贡献量指标
- Java Scanner类的方法及用法(很详细)
- 如何下载Tomcat
热门文章
- Centos7 linux 卸载自带安装的jdk 并yum自动安装jdk1.8
- Wine 2.10 发布,Windows 应用兼容层
- 《大数据导论》一1.4 案例学习背景
- Swiper 滚动插件
- OSPF LSA详解
- poj_2299Ultra-QuickSort,树状数组离散化
- 关闭linux日志功能后性能测试
- Jquery调用Web Service
- matlab imadjust将暗图像分别在RGB与HSV域增加亮度
- linux bsd命令,科学网—Linux/BSD下join命令使数据以tab为分隔符的方法 - 李雷廷的博文...