将tif文件转换成mrc文件

https://www.nzwang-lab.net/2018/07/18/Tif2MRC/

首先将tiff堆转换成单页

path='/home/arine-lab/Reference/'; %原文件路径
savepath='/home/arine-lab/list_tiff/';   %新文件路径    for i=1:100   %图片层数，可通过windows图片查看器知晓  I = imread([path,'NameOfTiff.tif'],i);   %读入文件的第i页imwrite(I,[savepath,num2str(i,'%04d'),'.tif']);   %保存单层图片，以其在原文件中的顺序命名
end

转换成mrc

<http://bio3d.colorado.edu/imod/doc/man/tif2mrc.html>

 tif2mrc [options]  TIFF_input_files...  MRC_output_file

批量将tif 转换成mrc的脚本

#!/bin/sh
#copy the exact files to a new dir ,and tif2mrc the files of the new dircd /home/list_tiff # home of tif pics
mkdir ../tif_list # a dir for tif_lists# 300 is the num of tif pics
for((i=1;i<=300;i++))
doa=$((10000+$i))mkdir ../tif_list/${a:1} for((j=i;j<i+25;j++))dob=$((10000+$j))cp ./${b:1}.tif ../tif_list/${a:1}/donetif2mrc -d ../tif_list/${a:1}/*.tif  ../mrc_list/${a:1}.mrc
done

参考链接

http://bio3d.colorado.edu/imod/doc/man/tif2mrc.html
https://hpc.nih.gov/apps/IMOD.html
http://bio3d.colorado.edu/imod/doc/mrc_format.txt

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转换成mrc

批量将tif 转换成mrc的脚本

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