R语言提示数学函数中用了非数学参数，求帮忙

expr_dat=read.table("TCGA.txt",comment.char="!",stringsAsFactors=F)

colnames(expr_dat)=expr_dat[1,]

df=expr_dat

df=df[-1,]

df <- na.omit(df)#

## volcano plot

logFC_cutoff <- with(df,mean(abs( logFC)) + 2*sd(abs( logFC)) )

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