python医学图像读取_python读取CT医学图像

需要安装OpenCV和SimpleItk。

SimpleItk比较简单，直接pip install SimpleItk即可。

代码如下：

#coding:utf-8

import SimpleITK as sitk

import cv2

#LKDS-00058,-102.655469971,108.188810974,438.759994507,12.2279986879

if __name__ == '__main__':

filename = "F:/cancer_solution/data/train_subset00/LKDS-00058.mhd"

ds = sitk.ReadImage(filename)

img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds)

frame_num, width, height = img_array.shape

outpath = "F:/cancer_solution/out/train/LKDS-00058"

index = -1

for img_item in img_array:

index = index + 1

cv2.imwrite("%s/%d.png"%(outpath,index),img_item)

print "done!"

如上所示，就将CT影像解析成了多个单幅图片。

目前还不太理解(x,y,z)坐标是如何对应的。

但祈世间人无病，何愁架上药生尘。癌症，终有一天可以被战胜。

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