python 画韦恩图（venn）代码(两组和三组数据)，简单易学易上手

韦恩图除了用R可以画之外，用python也可以画，通过对两个阶段的对应的geneid进行韦恩图展示，即可以知道两个阶段重叠的内容有多少，并通过写代码，取出两个阶段重叠部分的数据。

import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib_venn
# import venn as venn
from matplotlib_venn import venn2, venn3, venn2_circles
import csv
import numpy as nplist2 = []
with open('me.csv', encoding='utf-8') as f2:f2_csv = csv.reader(f2)for i, row1 in enumerate(f2_csv):if i >= 1:list2.append(row1[0])   #row1[0] 是一列geneid的内容list3 = []
with open('oo.csv', encoding='utf-8') as f2:f2_csv = csv.reader(f2)for i, row3 in enumerate(f2_csv):if i >= 1:list3.append(row3[0]) #row3[0] 是一列geneid的内容# 三组数据的画法，用venn3
# g = matplotlib_venn.venn3(subsets=[set(list), set(list2), set(list3)],  # 传入三组数据
#                           set_labels=('Label 1', 'Label 2', 'Label 3'),  # 设置组名
#                           set_colors=("#01a2d9", "#31A354", "#c72e29"),  # 设置圈的颜色，中间颜色不能修改
#                           alpha=0.8,  # 透明度
#                           normalize_to=1.0,  # venn图占据figure的比例，1.0为占满
#                           )
# plt.show()#两组数据的画法，用venn2
f = venn2(subsets=[set(list2), set(list3)],set_labels=('me', 'oo'),set_colors=("#098154", "#c72e29"),alpha=0.6,  # 透明度normalize_to=1.0)f.get_patch_by_id('10').set_edgecolor('red')#左圈外框颜色
f.get_patch_by_id('10').set_linestyle('--')#左圈外框线型
f.get_patch_by_id('10').set_linewidth(2)#左圈外框线宽
f.get_patch_by_id('01').set_edgecolor('green')#右圈外框颜色
f.get_patch_by_id('11').set_edgecolor('blue')#中间圈外框颜色
# plt.show()plt.annotate('intersection genes',color='black',xy=f.get_label_by_id('11').get_position() + np.array([0, 0.05]),xytext=(20, 80),ha='center', textcoords='offset points',bbox=dict(boxstyle='round,pad=0.5', fc='grey', alpha=0.6),arrowprops=dict(arrowstyle='-|>', connectionstyle='arc3,rad=-0.5', color='black'))
plt.show()
plt.savefig('./me-oo') #保存为png图片

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