signature=f89e259b8a982ede42b69434f81f5bc3,利用 cDNA-AFLP技术鉴定马铃薯晚疫病菌小种特异无毒基因候选表达序列...
摘要:
通过对由具有6个无毒基因不同表现型的马铃薯晚疫病菌构建的4个混合池进行cDNA-AFLP分析,共获得85个与无毒基因相关的差异表达片段,其中与无毒基因Avr1、Avr2、Avr3-Avr10-Avr11、Avr4相关的差异表达片段分别为20, 28, 16和21个。将这些差异表达片段对20个晚疫病病菌个体进行无毒基因差异表达验证,得到无毒基因连锁群Avr3-Avr10-Avr11的候选片段1个,即A11T13Avr3-10-11S157;无毒基因Avr4的候选片段2个,即A24T19Avr4S125和A24T24Avr4S144。Blast分析表明:A11T13Avr3-10-11S157与马铃薯晚疫病菌正萌发孢子囊(germinating sporangium)EST(expressed sequence tag)库中的序列PG001F10.XT7同源;A24T19Avr4S125与晚疫病菌正萌发孢囊(germinating cyst)EST库中的PH051G10.XT7部分序列完全一致;未发现与A24T24Avr4S144同源的序列,说明此序列可能为一新的马铃薯晚疫病菌EST.A24T19Avr4S125与EST PH051G10.XT7的序列一致性表明选择正在萌发的孢囊时期鉴定无毒基因的可行性,也为进一步快速获得全长无毒基因Avr4及进行功能验证奠定了基础.
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