CMAQ-5.2安装及测试数据运行

今天分享的是CMAQ-5.2的安装，首先陈述一下依赖库的环境：

①ioapi-3.2

②openmpi-1.4.3-intell11.1

③netcdf-4.0.1（netcdf4.2之前的版本还没有分成C库和fortran库分别安装编译）上述软件是提前安装好的，由于今天的主题是CMAQ安装，所以这里对上述三个依赖软件安装不做赘述，之后会单独介绍。

接下来是从CMAQ官网下载CMAQ-5.2.zip，下载过程不稳定，确保网络通常，最好连接外网VPN。下面开始安装过程：

（1）把安装包放在Linux系统中你期望的位置开始解压

unzip CMAQ-5.2.zip

（2）解压完成出现CMAQ-5.2文件夹，进入该文件夹

cd CMAQ-5.2

（3）打开bldit_project.csh，将CMAQ_HOME设置为你的CMAQ-5.2文件夹所在的路径即可，然后保存退出

vi bldit_project.csh

（4）运行bldit_project.csh脚本，初始化环境，生成data和lib空文件夹，如图所示

./bldit_project.csh

（5）打开config_cmaq.csh，在自己系统所使用的编译器下面修改编译配置

vi config_cmaq.csh

我这里用的intel编译器，所以在intel下面修改，根据蓝色提示文字进行修改，修改结果如图所示：

IOAPI_MOD_DIR：ioapi的模块文件路径，即lib文件夹的路径；

IOAPI_INCL_DIR：ioapi的include文件夹的路径

IOAPI_LIB_DIR：ioapi的lib文件夹的路径

NETCDF_LIB_DIR：netcdf的lib文件夹的路径

NETCDF_INCL_DIR：netcdf的include文件夹的路径

MPI_LIB_DIR：openmpi的lib文件夹的路径

myFC："mpif90"，使用的Fortran编译器的语法规范

myLINK_FLAG："-openmp"（如果是gfortran编译器，则为-gopenmp）

注释掉setenv extra_lib "-lcurl"，取消setenv extra_lib ""的注释

mpi_lib： "-lmpi"（mpich选择-lmpich，openmpi选择-lmpi）

在I/O API，netCDF，and MPI libraries下面修改netcdf_lib："-lnetcdf"（"-lnetcdf -lnetcdff"为netcdf-4.2版本及其之后的版本）。修改完之后保存退出，并且运行config_cmaq.csh脚本，会在lib文件夹中自动创建链接，打开查看是否正确创建链接，如图所示，如果文件夹湖蓝色或者蓝色，则为正确，闪烁红色及存在问题。

./config_cmaq.csh intel

（6）打开CCTM文件夹，进入scripts文件夹，运行bldit_cctm.csh

cd CCTM/scripts
./bldit_cctm.csh intel
cd BLD_CCTM_v52_intel
ls *exe

如果上述步骤都正确，则会生成BLD_CCTM_v52_intel文件夹，在该文件夹中存在CCTM_v52.exe可执行程序，如果没有生成可执行程序，则需要根据运行bldit_cctm.csh中的报错信息进行相关调整。

至此CMAQ-5.2安装成功，接下来进行测试数据的运行：

（1）首先解压测试输入数据，将得到的文件夹移动至data文件夹

tar -xvf CMAQv5.2_Benchmark_SingleDay_Input_09_12_2017.tar.gz
mv SE52BENCH CMAQ-5.2/data

（2）进入CCTM/scripts，打开run_cctm.csh脚本，修改运行配置

cd CCTM/scripts
vi run_cctm.csh

设置运行方式PROC（serial串行，mpi并行），如果是并行，可以修改@NPCOL和@NPROW，两者乘积为并行所调用的总核数，根据自己的系统配置修改。这里选择的是mpi并行运行。然后注释掉limit行，设置MPI=openmpi的bin文件夹路径，设置MPIRUN=$MPI/mpirun，删除time mpirun -r ssh -np $NPROCS $BLD/$EXEC中的-r ssh部分，如下图所示。修改完之后保存退出，然后运行run_cctm.csh脚本，运行时间较长，适合提交作业后台运行。

运行完成后在data文件夹会生成相应的output文件夹，进入查看LOGS，分别查看日志文件，均显示Program completed successfully字样，如图所示即为运行成功。之后可以下载官网提供的测试输出数据进行比对，确认结果相差无几，那么CMAQ就可以在你的系统上正确运行啦！

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