批量读取文件夹下所有excel文件里的内容，放入列表 把所有不管行列名如何excel合并成一个大的excel 批量读取excel，批量合并excel
批量读取文件夹下所有excel文件里的内容，放入列表 把12个excel读取，放入一个list里面 把文件夹下所有的excel里的所有内容分别读取，放入一个list
library(patchwork)
library(ggplot2)
library(ggalluvial)
library(svglite)
library(Seurat)
library(openxlsx)getwd()
path = "G:/silicosis/sicosis/yll/overlapped_clusters_0228/"
dir.create(path)
setwd(path)
getwd()
**
文件内容如下**
#方式二
library(openxlsx)
path<-"G:/silicosis/sicosis/yll/overlapped_clusters_0228/just_overlapped_noothers" #设置读取路径
files <- list.files(path, pattern = "*.xlsx$", full.names = TRUE) #读取xlsx文件名, pattern的值是正则表达式
files
文件夹下有如下几个excel
dat<-list()
for(i in 1:length(files)) {dat<-c(dat,list(read.xlsx(files[[i]],colNames = TRUE))) #读取Excel文件并合并到列表
}
把12个excel读取，放入一个list里面
把文件夹下所有的excel里的所有内容分别读取，放入一个list
**
结果展示
**
如果按照以下方法读取，则会得到一个dataframe
#方式三
library(openxlsx)
path<-"..." #设置读取路径
path
files <- list.files(path, pattern = "*.xlsx$", full.names = TRUE) #读取xlsx文件名, pattern的值是正则表达式
files
dat<-sapply(files,read.xlsx)head(dat)
**
如果按照以下方式读取，则可以把所有的excel里的内容都按行堆积合并成一个大的excel表格
**
getwd()
setw("G:/silicosis/sicosis/yll/overlapped_clusters_0228/just_overlapped_noothers")
files = list.files("./", pattern = "xlsx", full.names = TRUE)
files
df = map_dfr(files, read_xlsx) # 批量读取+按行堆叠合并
df
结果展示如下
**
x下面这算法和前面算法很像，输出时候，也可以把所有的excel里的内容都按行堆积合并成一个大的excel表格 但是在r中view结果时候，是显示有很多na的 把所有不管行列名如何excel合并成一个大的excel
**
getwd()
file="G:/silicosis/sicosis/yll/overlapped_clusters_0228/just_overlapped_noothers_po.q_o.7foldchage"
dir.create(file)
setwd(file)
#方式二
library(openxlsx)
path<-"G:/silicosis/sicosis/yll/overlapped_clusters_0228/just_overlapped_noothers_po.q_o.7foldchage" #设置读取路径
files <- list.files(path, pattern = "*stat.xlsx$", full.names = TRUE) #读取xlsx文件名, pattern的值是正则表达式
files
dat<-list()
for(i in 1:length(files)) {dat<-c(dat,list(read.xlsx(files[[i]],colNames = FALSE))) #读取Excel文件并合并到列表
}
dim(dat)
dat
length(dat)dat[[2]][1:4,1:4]
dat[[4]][1:4,1:4]a=list()
for (i in 1:11) {print(paste0("dat","[","[",i,"]","]"))a[[i]]=paste0("dat","[","[",i,"]","]")
}
a[1:11]#再把刚制作好的列表合并
mydata=dplyr::bind_rows(dat[[1]],dat[[2]],dat[[3]],dat[[4]],dat[[5]],dat[[6]],dat[[7]],dat[[8]],dat[[9]],dat[[10]],dat[[11]])
head(mydata,10)
dim(dat[[1]])
dim(dat[[2]])
glimpse(dat[[1]])
dim(mydata)
glimpse(mydata)
View(mydata)
View(dat[[1]])
View(dat[[2]])getwd()
setwd(file)
getwd()
write.xlsx(mydata,"all_mymerged_markers_rigion_interacted_clusters.xlsx")j结果展示
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