使用ImageJ软件计算信噪比（SNR）的小工具

本人是做医学影像设备的，最近在做一款X光片读取的机器。生产出厂检测时，需要检查一下读取的X光片图像的信噪比（SNR）。

1. 先说一下SNR检测的方法：

1）先拍一张X光片，机器读取光片，图像存在固定的目录

2）用ImageJ软件打开图像，选取10个不同的区域，分别求出10组不同区域的平均灰度值MEAN_AVERAGE和平均方根差STD_AVERAGE.

3）SNR = MEAN_AVERAGE/STD_AVERAGE

2. 使用宏实现1中的操作，修改StartupMacros.txt文件如下：

macro "SNR TEST" {
var area;
var mean;
var max;
var std;

var sum_area = 0;
var sum_mean = 0;
var sum_max = 0;
var sum_std = 0;
var SNR;

open("C:\\s2terminal\\image.dcm"); //打开图像文件
run("Grid ", "grid=Lines area=9 color=Cyan");

makeRectangle(152, 250, 98, 102);//选取第一个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std +std;

makeRectangle(352, 250, 98, 98);//选取第2个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

makeRectangle(552, 352, 100, 94);选取第3个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

makeRectangle(352, 550, 98, 100);//选取第4个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

makeRectangle(652, 550, 100, 104);//选取第5个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

makeRectangle(352, 1052, 98, 94);选取第6个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

makeRectangle(150, 852, 100, 98);//选取第7个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

makeRectangle(352, 852, 98, 100);选取第8个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

makeRectangle(550, 852, 102, 100);//选取第9个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

makeRectangle(750, 950, 100, 98);//选取第10个区域
getStatistics(area, mean, min, max, std, histogram);
sum_area = sum_area + area;
sum_mean = sum_mean + mean;
sum_min = sum_min + min;
sum_max = sum_max + max;
sum_std = sum_std + std;

sum_mean = sum_mean/10;//mean_average
sum_std = sum_std/10;
SNR = (16383 - sum_mean)/sum_std;//std_average
sum_mean = 16383 - sum_mean;
print("16383 - sum_mean = "+sum_mean);
print("average std = "+sum_std);
print("SNR = "+SNR);

close();

}

macro "About ImageJ Action Tool - C059T3e16S" {
doCommand("SNR TEST");
}

3. 重新启动软件，界面如下：

用户可以直接点击S键或者SNR TEST菜单，直接计算SNR.

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