dnastar拼接反向互补序列_反向互补、反向、互补序列有何区别？

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一、顺序不同62616964757a686964616fe58685e5aeb931333433616234：

原序列：AATTCCGG，

则反向序列为：GGCCTTAA 就是原序列反过来；

互补序列：TTAAGGCC 就是与原序列互补；

反向互补：CCGGAATT 就是与反向序列互补。

二、概念不同：

互补的概念就是A-T，C--G配对

要将核苷酸序列转换成反向互补序列，需要用DNASTAR软件，其中有EditSeq组件。

三、序列编码不同：

在用DNAMAN的多序列比对时，包括编码链和非编码连的比对，测序得到的目的片段可能是非编码链(即目的基因的编码链的互补序列)，而NCBI中提交的序列都是编码链的序列。

#!usr/bin/perl/-w

print "put in";

$a=;

chomp($a);

@q=split (//,$a);

@p=reverse @q;

foreach my $i (@p){

if ($i eq "A"){print "T";}

elsif ($i eq "T"){print "A";}

elsif ($i eq "G"){print "C";}

elsif ($i eq "C"){print "G";}

}

扩展资料：

利用反向PCR可对未知序列扩增后进行分析，探索邻接已知DNA片段的序列，并可将仅知部分序列的全长cDNA进行分子克隆，建立全长的DNA探针。适用于基因游走、转位因子和已知序列DNA旁侧病毒整合位点分析等研究。

用传统的缓冲液和其他提供者推荐的条件裂解DNA。反向PCR所扩增的片段的大小由 PCR扩增片段的大小决定，PCR扩增的实际上限为3-4kb。

能裂解核心区的内切酶使反向PCR只能扩增引物所定模板(依赖于引物)的上游或上游区，而不裂解核心区的酶则使两上边侧序列都扩增，并带有由内切酶和环化类型决定的接点(例如，互补突头连接与钝头连接)。

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