matlab对矩阵求模,Matlab中Harwell-boeing格式稀疏矩阵的读取及绘图
最近在做稀疏矩阵的相关工作,其中一项是绘制稀疏矩阵的结构图。经过一下午研究,将相关成果整理如下:
matlab源代码为:
1、文件 test_bcsstk01.m:
% 绘制稀疏矩阵 bcsstk01.rsa 和 bcsstm01.rsa 的结构图
clear
% 读入rsa形式的刚度矩阵
Dpi = 150;
hb_to_mmm('matrix\bcsstk01.rsa','matrix\bcsstk01');
load matrix\bcsstk01;
ni=bcsstk01(1,1); %稀疏矩阵的行
nj=bcsstk01(1,2); %稀疏矩阵的列
nz=bcsstk01(1,3); %稀疏矩阵的非零元总数
nl=nz+1; %总行数
KL=sparse( bcsstk01(2:nl,1), bcsstk01(2:nl,2), bcsstk01(2:nl,3),
ni, nj ); %转换为稀疏矩阵(刚度矩阵下三角)
[dr,va]=get_diag(bcsstk01(2:nl,1),bcsstk01(2:nl,2),bcsstk01(2:nl,3),nz); %提取对角线元素
KD=sparse( dr, dr, va, ni, nj
); %刚度矩阵的对角线元素
K = KL + KL' -
KD; %得到最后的刚度矩阵
clear KL;
clear KD;
clear dr;
clear va;
figure(1)
subplot(1, 2, 1)
spy(K)
title('矩阵 bcsstk01.rsa 的结构图');
% 读入rsa形式的质量矩阵
hb_to_mmm('matrix\bcsstm01.rsa','matrix\bcsstm01');
load matrix\bcsstm01;
ni=bcsstm01(1,1); %稀疏矩阵的行
nj=bcsstm01(1,2); %稀疏矩阵的列
nz=bcsstm01(1,3); %稀疏矩阵的非零元总数
nl=nz+1; %总行数%得到最后的刚度矩阵
ML=sparse( bcsstm01(2:nl,1), bcsstm01(2:nl,2), bcsstm01(2:nl,3),
ni, nj ); %转换为稀疏矩阵
[dr,va]=get_diag(bcsstm01(2:nl,1),bcsstm01(2:nl,2),bcsstm01(2:nl,3),nz); %提取对角线元素
MD=sparse( dr, dr, va, ni, nj
); %刚度矩阵的对角线元素
M = ML + ML' -
MD;
clear ML;
clear MD;
clear dr;
clear va;
subplot(1, 2, 2)
spy(M)
title('矩阵 bcsstm01.rsa 的结构图');
SDpi=['-r',num2str(Dpi)]; % 设定输出图像的 Dpi 值
print(1,'-dtiff', SDpi, 'bcsstk01_bcsstm01'
); % 将图像按规定 Dpi 和 文件名写入到文件
2、文件 get_diag.m:
function [dr,va]=get_diag(row,col,val,nz)
index=1;
sum =0;
for i=1:nz
if( row(i,1)
== col(i,1) )
dr(index,1) = row(i,1);
va(index,1) = val(i,1);
if( val(i,1) < 1e-20 )
sum = sum + 1;
end
index = index + 1;
end
end
if( sum > 0 )
warning('对角线元素上有 %d 个小于或等于0的元素.',sum)
end
end
3、文件 hb_to_mmm.m:
下面附上绘制的结果图:
参考文献:
【总结】Harwell-Boeing格式矩阵转换为稀疏矩阵的方法
注:
【问题】昨天这个程序似乎有些问题:hb_to_mmm.m文件得到的非零元个数似乎比实际的要少。
例如:bcsstk09.rsa这个文件,如果只考虑下三角部分,实际上共有9760个非零元,而若先用hb_to_mmm.m文件得到一个matlab格式的矩阵文件bcsstk09,再读入用spconvert函数转化成稀疏矩阵之后,虽然仍有9760个非零元,但其中许多非零元的数值却被设置为0了(直接查看bcsstk09.rsa文件,发现这些位置处的非零元数值为e-7/e-8量级)!这样,当再调用spy函数画出刚度矩阵下三角的非零元个数时,就只有9039个了。
【解决方案】修改hb_to_mmm.m文件的msm_to_mm_coordinate_real_general函数,将第1445行:
fprintf ( fid, ' %d %d %f\n', rows(k2), j, vals(k2) )
改为
fprintf ( fid, ' %d %d %e\n', rows(k2),
j, vals(k2) )
即可。
【结果】
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