对于哨兵二号数据以及LANDSAT8数据,SNAP中有已经集成好的模块计算LAI。其算法主要基于辐射传输模型,可生成植被特征和TOC反射率的综合数据库,然后训练神经网络从TOC反射率估算冠层特征,并设置相应的角度定义观测配置。LAl输出将由算法在每个像素上的应用提供。除了产品值之外,还会生成描述输出有效性的质量标志(flags)。
此模块在Optical->Thematic Land Processing->Biopyhsical Processor目录下面。

对于经过Sen2Cor处理好的数据,需经过重采样才可进行计算。重采样模块在Raster->Geometric->Resampling目录下面。
如果选择Biopyhsical Processor S2_10m进行计算,则需要将所有的波段都重采样为10米(哨兵二号的第二波段为10米,可据此波段进行重采样)。
默认重采样方法是最近邻法。

Biopyhsical Processor S2_10m可以计算出LAI、FAPAR和FVC,Biopyhsical Processor S2可以计算出LAI、FAPAR、FVC、Cab以及CWC。各个含义为:
LAI:叶面积指数;
FAPAR:吸收的光合有效辐射的分数;
FVC:植被覆盖率;
Cab:叶片叶绿素含量;
CWC:冠层含水量。

将经过Sen2Cor处理、重采样后的数据加载进来,计算LAI(其他选项不需要可以取消勾选),并设置输出格式为ENVI。

输出的数据有两种,LAI和质量标志(flags)。

此处只需LAI的影像即可(flags曾看到一个博主分析过,大家有兴趣的可以去查阅)。在ENVI中打开LAI图像。

可以看到此处的LAI为4.11,一般来说NDVI值大的地方,LAI的值也会相对比较高。

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