关于人类参考基因组及注释文件，一篇就够了

最近随着课题进展拿到二代测序数据，想要在学校通过VPN连接之前工作单位时的服务器传输数据进行生信分析，传输成功的可能性几乎为零，借着这个原由，也下了决心开始启用现在实验室给我分配的的服务器账号，意味着我在之前单位安装的软件、下载的数据库都需要重新安装、下载(为了更新一下)，当然，课题接下来需要用的软件数目和数据库的种类及大小将会成为一个大工程。本想全交给课题组的计算机老师，但两人在沟通两次后，工程量太大，决定两个人一块来整，祈祷宿舍早点能够执行晚11点关门的政策……

最先下载的当属人类参考基因组了， 21年前，人类参考基因组首次公布，从此开启了基因组学研究的飞速发展时期，也迎来了生物信息学的快速发展。今年4月初，science连发6篇封面文章，宣布人类完整基因组测序计划正式完成。可见，这些年人类参考基因组总是在不断完善过程中，因此也有了不同的版本。不同的数据库均提供了下载链接，比如NCBI、UCSC、ENSEMBLE，网上有太多介绍了，希望刚开始学习的同学分别进入这些网站看一下，注意一下它们之间的区别，只要你是在同一网站下载的对应序列文件和注释文件，用来做参考基因组及注释文件都没有问题。

一、GENCODE中下载：

[外链图片转存中…(img-6hCJROAy-1651044501693)]

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