Python将多张2D TIFF图片转为一个3D TIFF文件

这里用到了两个处理TIFF图片的库：libtiff 和 tifffile

libtiff里面的TIFF提供了读取TIFF图片的功能，但是如果使用它提供的示例代码保存3D TIFF则会乱码（TIFF文件乱码）。因此又尝试了tifffile，保存成功。

代码如下：

# coding: utf-8
import os
import numpy as np
from libtiff import TIFF
import tifffilevolume = []
Files_Path = './volume' #把你的所有图片放在py文件同目录下的volume文件夹
imgList = os.listdir(Files_Path) #读取文件目录下的所有文件名
imgList.sort(key=lambda x: int(x.split('.')[0]))  # 按照数字顺序排列图片，图片名示例：1.tif, 2.tif, 3.tif, 4.tif, 5.tif ...
for count in range(0, len(imgList)):tif = TIFF.open(Files_Path + '/' + imgList[count], mode='r')tif = np.array(list(tif.iter_images()))if tif.shape[0] == 1:tif = tif.squeeze(0)else:assert tif.shape[0] == 1volume.append(tif)
volume = np.array(volume)
print('Read success.')
tifffile.imsave(Files_Path + '.tif', volume)

经过测试，我发现volume文件夹里面的图片数量需要在5个以上（包含5个），否则输出的并不是3D TIFF。或许有大佬有兴趣扒一下底层代码。

我上传了程序和5张2D TIFF图片可供测试，解压运行即可：

链接：https://pan.baidu.com/s/1Z_1BBpOl8ssbxbcZyQUd1w
提取码：wrtb

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