graphpad分组百分比柱状图_Graphpad Prism 8.0绘制分组散点图与柱状图共存图
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上图是Acta Neuropathologica(最新影响因子15.876)文献中(doi.org/10.1007/s00401-018-1954-4)散点图与均值加减误差共存图,这种统计图表的优势是相较柱状图除了能够显示均值与误差外还可以显示所有数据点的分布,增加文章的可信度的同时也更美观,因此在诸多高分文献中得到了广泛使用。误差一般有两种呈现形式,SD标准差与SEM标准误,两者关系为SEM=SD/Sqrt(n),因此SEM远远小于SD。那么均值加减误差,散点图,与散点图与柱状图共存图是什么关系呢?使用最新版Graphpad Prism 8.0绘制上述几种图形如下:
三种图形均为mean±SD,因此其均值与SD均相同,散点图在mean±SD的基础上加上了所有的数据点,散点图与柱状图共存图在散点图的基础上在均值处加了两根竖线使之闭合为一根柱子,如下图所示:
那么如何绘制上述三种不同类型的统计图呢?
输入数据后在Graphs下选择对应的图表类型即可:
如果不想显示数据点,仅显示均值与误差,双击散点图,进入Format Graph,将散点Symbols大小Size设置为0即可:
扩展:
如何计算Mean,SD与SEM?
1、 Graphpad Prism 8.0计算Mean,SD与SEM
点击Analyze,选择Column statistics下的描述统计
进入以下页面,选择分析其最大值、最小值、范围,Mean,SD,SEM以及90%分位数:
点击OK,得到以下结果:
2、 Excel计算Mean,SD与SEM
以Con组为例,就利用Average函数可以计算均值,STDEV.S可以计算SD, SEM=SD/sqrt(n)可以计算SEM,且计算结果与Graphpad Prism 8.0计算结果一致:
Graphpad Prism 8.0除了作图功能强大外,统计分析方面也非常强大。
言归正传,Graphpad Prism 8.0新功能之一是能够绘制分组柱状图与散点图共存图:
步骤如下:
1、 打开Graphpad Prism 8.0,选择Grouped,输入分组数据:
Control与Treated分为Wild type、Knock-out A &B三种不同的基因型。
2、在Graphs下选择Graph family为Grouped,Individual values下选择分组柱状图与散点图共存图,Plot可以选择Mean±SD或Mean±SEM,下方有预览,点击OK:
得到以下图形:
3、 双击图形,进入Format Graph进行三点颜色及形状、大小等设置美化即可:
4、 导出图片
关于图片导出,GraphPad Prism 8.0导出tiff图片最大分辨率(dpi)可高达1200 dpi,对于导出图像的大小GraphPad Prism 8.0也有提高,Prism 7只能导出最大宽度达到11英寸tiff图片,而GraphPad Prism 8.0将最大宽度提升至25英寸。
最后,回到最开始分享的图片:
为什么文献中图片三点颜色在一组中分为五种颜色?
因为作者分析了来自五个独立小鼠的25-49个细胞,不同颜色代表了该数据点的来源来自不同的动物,这种表现形式又丰富了图片呈现的内容。那么这种不同组的数据点显示不同的颜色Graphpad Prism 8.0可以实现吗?答案是暂时不可以,但是我们可以使用Origin软件实现。以下每组数据均来源于4只动物,每只动物贡献2-4个数据不等,C列为其分组:
将原始数据输入Origin:
选中A、B两列,点击Plot,2D下选择Box,选择Bar Overlap:
得到基本图形如下:
双击图形,进入Plot Details-Plot Properities:
选择Symbol:
Symbol Color选择By points,Use column values,Indexing选择C列,即以C列的分组确定颜色:
得到同一组中来自不同老鼠的数据显示不同颜色,共显示四种颜色:
散点图方法相同,使用Symbol Color选择By points,Use column values,Indexing选择C列,即以C列的分组确定颜色:
今天给大家分享使用Graphpad Prism 8.0软件绘制分组柱状图与散点图共存图就到此为止,希望对大家有所帮助,谢谢大家!
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