Seurat4.0系列教程8：细胞周期评分和回归分析
此教程展示了如何通过基于传统细胞周期相关marker计算细胞周期得分，并在预处理过程中将这些分数从数据中回归，以消除 scRNA-seq 数据中细胞周期异质性的影响。数据：
https://www.dropbox.com/s/3dby3bjsaf5arrw/cell_cycle_vignette_files.zip?dl=1
library(Seurat)# Read in the expression matrix The first row is a header row, the first column is rownames
exp.mat <- read.table(file = "../data/nestorawa_forcellcycle_expressionMatrix.txt", header = TRUE, as.is = TRUE, row.names = 1)# A list of cell cycle markers, from Tirosh et al, 2015, is loaded with Seurat. We can
# segregate this list into markers of G2/M phase and markers of S phase
s.genes <- cc.genes$s.genes
g2m.genes <- cc.genes$g2m.genes# Create our Seurat object and complete the initalization steps
marrow <- CreateSeuratObject(counts = exp.mat)
marrow <- NormalizeData(marrow)
marrow <- FindVariableFeatures(marrow, selection.method = "vst")
marrow <- ScaleData(marSeurat4.0系列教程8：细胞周期评分和回归分析相关推荐
- 黄聪：Microsoft Enterprise Library 5.0 系列教程(二) Cryptography Application Block (高级)
原文:黄聪:Microsoft Enterprise Library 5.0 系列教程(二) Cryptography Application Block (高级) 本章介绍的是企业库加密应用程序模块 ...
- 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之二应用知识梳理逻辑！
原创PDF |<Android 深入系统完全讲解>免费开源,可能价值百万! 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之一环境搭建&&跑起来模拟器! 写完了第一篇,跑去 ...
- 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之三Ability概述调用方法！
原创PDF |<Android 深入系统完全讲解>免费开源,可能价值百万! 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之一环境搭建&&跑起来模拟器! 王姨劝我学Harm ...
- 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之四Git搭建下载实例！
原创PDF |<Android 深入系统完全讲解>免费开源,可能价值百万! 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之三Ability概述&&调用方法! 相信大家看了 ...
- 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之六自定义View涂鸦项目实战！
这一节写个简单的项目,涂鸦,简单来讲就是画什么,显示什么.最好的网站,就是官网,这里再发一下: https://developer.harmonyos.com/cn/docs/documentatio ...
- 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之五布局方法点击响应！
原创PDF |<Android 深入系统完全讲解>免费开源,可能价值百万! 王姨劝我学HarmonyOS鸿蒙2.0系列教程之三Ability概述&&调用方法! 为了更好的交 ...
- python3.6 django教程_【Python3.6+Django2.0+Xadmin2.0系列教程一】环境搭建及项目创建
由于工作需要,接触了大半年时间的Django+xadmin框架,一直没空对这块对进行相关的梳理.最近在同事的怂恿下,就在这分享下笔者的学习及工作经验吧. 好了,话不多说,下面开始进入正题: 环境需求: ...
- 黄聪：Microsoft Enterprise Library 5.0 系列教程(七) Exception Handling Application Block
黄聪:Microsoft Enterprise Library 5.0 系列教程(七) Exception Handling Application Block 原文:黄聪:Microsoft Ent ...
- 【Python3.6+Django2.0+Xadmin2.0系列教程之一（入门篇-上）】环境搭建及项目创建
由于工作需要,接触了大半年时间的Django+xadmin框架,一直没空对这块对进行相关的梳理.最近在同事的怂恿下,就在这分享下笔者的学习及工作经验吧. 好了,话不多说,下面开始进入正题: 转载请注明 ...
最新文章
- 如何在HHDI中进行数据质量探查并获取数据剖析报告
- 实现Date函数属性中的format方法
- 物体的三维识别与6D位姿估计：PPF系列论文介绍（四）
- 077_html5拖放
- 卡尔曼滤波器_使用卡尔曼滤波器和路标实现机器人定位
- Element UI——数字输入框解决方案
- Java 8的方法参考进一步限制了重载
- C#中的变量类型（值类型、引用类型）
- 超融合将成为数据中心技术应用主流
- 解决VS2017中出现'strcpy': This function or variable may be unsafe. Consider using strcpy_s instead这问题
- 明年3月开卖！小米11超大杯有望搭载屏下摄像头技术
- antd tree搜索并定位_KD-Tree原理详解
- Transactional Replication2：在Subscriber中，主键列是只读的
- 矩池云上安装caffe gpu教程
- 汇总Eclipse快捷键
- unicode什么意思中文_请问Unicode中文，日文，韩文，西欧语言等的编码区间是什么？...
- 可以获得高排名的B2B平台大全
- 数字功放和模拟功放有哪些区别
- java web ip_详解Java Web如何限制访问的IP的两种方法
- 用F5529控制OLED输出汉字，字符，以及bmp图片