html查看蛋白质,若干常用蛋白质结构与位点分析网站
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几个常用蛋白质分析网站,分享一下!
1.从氨基酸组成辨识蛋白质
ExPASy:http://www.expasy.ch/tools/
PROSEARCH:http://www.embl-heidelberg.de/prs.html
2.预测蛋白质的物理性质:等电点、分子 量、酶切特性、疏水性、电荷分布等
ExPASy:http://www.expasy.ch/tools/
FASTA:ftp://ftp.virginia.edu/pub/fasta/
SAPS:http://www.isrec.isb-sib.ch/software/SAPS_form.html
3.跨膜区预测:http://www.isrec.isb-sib.ch/software/tmpred_from.html
4.蛋白质二级结构预测
nnPredict:http://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict.html
PredictProtein:http://cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/
PredictProtein的国内镜像:http://www.cbi.pku.edu.cn/predictprotein/
SOPMA:http://pbil.ibcp.fr/
5.二级结构预测:www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict-instrucs.html
6.卷曲螺旋预测
COILS:http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html
7.跨膜区段和在膜上的取向预测
TMpred:http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html
8.信号肽的剪切位点
SignalP:http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
9.蛋白质的三维结构
SWISS-MODEL:http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html
CPHmodels:http://www.cbs.dtu.dk/services/CPHmodels/
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