Python Network（二）绘图draw系列draw()，draw_networkx()，draw_networkx_nodes()，draw_networkx_edges()
2024-05-09 07:08:23
Python Network（一）
目录
- 总述
- 1. nx.draw()
- 1.1 示例
- 1.2 pos参数可选内容
- 2. draw_networkx()
- 2.1 示例
- 2.2 补充：matplotlib颜色对照表
- 3. draw_networkx_nodes()
- 3.1 示例
- 3.2 font-family常用字体列表
- 4. draw_networkx_edges()
- 4.1 示例
- 5. draw_networkx_labels()
- 5.1 示例
- 6.draw_networkx_edge_labels()
- 6.1 示例
本文主要讲解network最后的绘图功能
总述
| 绘图 | 释义 |
|---|---|
| draw(G[, pos, ax, hold]) | 用Matplotlib绘制图形G |
| draw_networkx(G[, pos, with_labels]) | 使用Matplotlib绘制图形G |
| draw_networkx_nodes(G, pos[, nodelist, …]) | 绘制图G的节点 |
| draw_networkx_edges(G, pos[, edgelist, …]) | 绘制图形G的边缘 |
| draw_networkx_labels(G, pos[, labels, …]) | 在图G上绘制节点标签 |
| draw_networkx_edge_labels(G, pos[, …]) | 绘制边缘标签 |
| draw_circular(G, **kwargs) | 用圆形布局绘制图形G |
| draw_random(G, **kwargs) | 用随机布局绘制图形G |
| draw_spectral(G, **kwargs) | 用频谱布局绘制图形G |
| draw_spring(G, **kwargs) | 用弹簧布局绘制图形G |
| draw_shell(G, **kwargs) | 使用外壳布局绘制networkx图 |
| draw_graphviz(G[, prog]) | 使用graphviz布局绘制networkx图 |
1. nx.draw()
默认情况下，将图形绘制为没有节点标签或边缘标签且使用完整Matplotlib图形区域且无轴标签的简单表示形式。有关允许标题，轴标签等的更多功能齐全的图形，请参见draw_networkx()
draw(G,pos = None,ax = None,hold = None,** kwds ）
| 参数 | 类型 | 意义 |
|---|---|---|
| G | 必选 | 网络图 |
| pos | 字典，可选 | 以节点为键，位置为值的字典。如果未指定，将计算弹簧布局位置。有关计算节点位置的功能，请参见networkx.layout |
| ax | Matplotlib Axes对象，可选 | 在指定的Matplotlib轴上绘制图形。 |
| hold | 布尔，可选 | 设置Matplotlib保持状态。如果为True，则随后的绘制命令将添加到当前轴。 |
| **kwds | 可选关键字 | 有关可选关键字的描述，请参见networkx.draw_networkx（） |
1.1 示例
import networkx as nx
# 创建空的网格
G=nx.Graph()
# 添加节点
G.add_node('JFK')
G.add_nodes_from(['SFO','LAX','ATL','FLO','DFW','HNL'])
# G.number_of_nodes() # 查看节点数，输出结果7# 添加连线
G.add_edges_from([('JFK','SFO'),('JFK','LAX'),('LAX','ATL'),('FLO','ATL'),('ATL','JFK'),('FLO','JFK'),('DFW','HNL')])
G.add_edges_from([('OKC','DFW'),('OGG','DFW'),('OGG','LAX')])
# 绘制网络图
nx.draw(G,pos=nx.circular_layout(G),with_labels=True)
1.2 pos参数可选内容
nx.circular_layout(nf)节点在圆环上均匀分布
nx.kamada_kawai_layout(nf) 这个低版本的network好像没有
nx.random_layout(nf)节点随机分布
nx.spectral_layout(nf)根据图的拉普拉斯特征向量排列节点（我也不知道这个是个啥）
nx.spring_layout(nf)用Fruchterman-Reingold算法排列节点（样子类似多中心放射状）
nx.shell_layout(nf)节点在同心圆上分布
2. draw_networkx()
使用Matplotlib绘制图形，并带有节点位置，标签，标题和许多其他图形功能的选项。有关没有标签或轴的简单绘图，请参见draw（）
draw_networkx （G，pos = None，with_labels = True，** kwds ）
| 参数 | 类型 | 意义 |
|---|---|---|
| G | 必选 | 网络图 |
| pos | 字典，可选 | 以节点为键，位置为值的字典。如果未指定，将计算弹簧布局位置。有关计算节点位置的功能，请参见networkx.layout |
| ax | Matplotlib Axes对象，可选 | 在指定的Matplotlib轴上绘制图形。 |
| with_labels | bool，可选（默认= True） | 设置为True以在节点上绘制标签 |
| nodelist | 列表，可选（默认G.nodes（）） | 仅绘制指定的节点 |
| edgelist | 列表，可选（默认值= G.edges（）） | 仅绘制指定的边缘 |
| node_size | 标量或数组，可选（默认为300） | 节点大小。如果指定了数组，则其长度必须与节点列表的长度相同。 |
| node_color | 颜色字符串或浮点数数组，（默认=“ r”） | 节点颜色。可以是单个颜色格式字符串，也可以是长度与节点列表相同的颜色序列。如果指定了数值，则将使用cmap和vmin，vmax参数将它们映射为颜色。有关更多详细信息，请参见matplotlib.scatter。 |
| node_shape | 字符串，可选（默认=‘o’） | 节点的形状。规范作为matplotlib.scatter标记，是’so ^> v <dph8’之一。 |
| alpha | 浮点型，可选（默认= 1.0） | 节点透明度 |
| cmap | Matplotlib颜色图，可选（默认=无） | 用于映射节点强度的颜色图 |
| vmin，vmax | 浮动，可选（默认=无） | 节点颜色图缩放的最小值和最大值 |
| linewidths | [无| 标量| 顺序] | 符号边框的线宽（默认= 1.0） |
| width | 浮动，可选（默认= 1.0） | 边缘线宽 |
| edge_color | 颜色字符串或浮点数数组（默认=‘r’） | 边缘颜色。可以是单个颜色格式字符串，也可以是与边列表长度相同的颜色序列。如果指定了数值，则将使用edge_cmap和edge_vmin，edge_vmax参数将它们映射为颜色。 |
| edge_cmap | Matplotlib颜色图，可选（默认=无） | 用于映射边缘强度的颜色图 |
| edge_vmin，edge_vmax | 浮点型，可选（默认=无） | 边缘颜色图缩放的最小值和最大值 |
| style | 字符串，可选（默认=‘solid’） | 边线样式（实线 |
| labels | 字典，可选（默认=无） | 字典中的节点标签，由文本标签的节点作为键控 |
| font_size | int，可选（默认= 12） | 文字标签的字体大小 |
| font_color | 字符串，可选（默认='k’黑色） | 字体颜色字符串 |
| font_weight | 字符串，可选（默认=‘正常’） | 字型粗细 |
| font_family | 字符串，可选（默认=‘sans-serif’） | 字体系列 |
| label | 字符串，可选 | 图例的标签 |
2.1 示例
import networkx as nx
# 创建空的网格
G=nx.Graph()
# 添加节点
G.add_node('JFK')
G.add_nodes_from(['SFO','LAX','ATL','FLO','DFW','HNL'])# 添加连线
G.add_edges_from([('JFK','SFO'),('JFK','LAX'),('LAX','ATL'),('FLO','ATL'),('ATL','JFK'),('FLO','JFK'),('DFW','HNL')])
G.add_edges_from([('OKC','DFW'),('OGG','DFW'),('OGG','LAX')])nx.draw_networkx(G,pos=nx.circular_layout(G),with_labels=True,alpha=0.5,node_color='yellow',node_shape='s',linewidths=4,width=2,edge_color='blue',style='--',font_size=15,font_color='blue',font_family='SimHei')
# pos选用圆形样式，with_labels=True在节点上绘制标签，alpha=0.5节点透明度
#linewidths=4节点边框宽度为4，node_color='yellow'节点颜色设为黄色，node_shape='s'节点的形状设为正方形
# width=2边的线宽2,edge_color='blue'设置边的颜色,style='--'边的线样式，
# font_size=15设置标签字号大小,font_color='blue'设置标签字体颜色,font_family='SimHei'设置标签字体
2.2 补充：matplotlib颜色对照表
3. draw_networkx_nodes()
这仅绘制图G的节点
draw_networkx_nodes(G,pos,nodelist = None,node_size = 300,node_color = 'r',node_shape = 'o',alpha = 1.0,cmap = None,vmin = None,vmax = None,ax = None, linewidths=None,label=None,**kwds)
| 参数 | 类型 | 意义 |
|---|---|---|
| G | 必选 | 网络图 |
| pos | 字典，可选 | 以节点为键，位置为值的字典 ，位置应为长度为2的序列 |
| ax | Matplotlib Axes对象，可选 | 在指定的Matplotlib轴上绘制图形。 |
| nodelist | 列表，可选（默认G.nodes（）） | 仅绘制指定的节点 |
| node_size | 节点的标量或数组大小（默认为300）。如果指定了数组，则其 长度必须与节点列表的长度相同。 | |
| node_color | 颜色字符串或浮点型 | 节点颜色的数组。可以是单个颜色格式字符串（default =‘r’）， 也可以是长度与节点列表相同的颜色序列。如果指定了数值，则将使用cmap和vmin，vmax参数将它们映射为颜色。有关 更多详细信息，请参见matplotlib.scatter。 |
| node_shape | string | 节点的形状。规范作为matplotlib.scatter 标记，是’so ^> v <dph8’（默认=‘o’）之一。 |
| alpha | float | 节点透明度（默认为1.0） |
| cmap | Matplotlib颜色图 | 用于映射节点强度的颜色图（默认为无） |
| vmin，vmax | 浮动 | 节点色彩图缩放的最小值和最大值（默认值：None） |
| linewidths | [无| 标量| 序列] | 符号边框的线宽（默认= 1.0） |
| label | [无| 字符串] |
3.1 示例
import networkx as nx
# 创建空的网格
G=nx.Graph()
# 添加节点
G.add_node('JFK')
G.add_nodes_from(['SFO','LAX','ATL','FLO','DFW','HNL'])
# 将节点分类
nodelist1=['SFO','LAX','ATL','FLO']
nodelist2=['DFW','HNL','JFK']# 添加连线
G.add_edges_from([('JFK','SFO'),('JFK','LAX'),('LAX','ATL'),('FLO','ATL'),('ATL','JFK'),('FLO','JFK'),('DFW','HNL')])# 绘制网络图
nx.draw_networkx_nodes(G,pos=nx.circular_layout(G),nodelist=nodelist1,alpha=0.6,node_color='blue',node_shape='p',node_size=200,linewidths=2)
nx.draw_networkx_nodes(G,pos=nx.circular_layout(G),nodelist=nodelist2,alpha=0.6,node_color='red',node_shape='v',node_size=220)
3.2 font-family常用字体列表
黑体：SimHei
宋体：SimSun
新宋体：NSimSun
仿宋：FangSong
楷体：KaiTi
仿宋_GB2312：FangSong_GB2312
楷体_GB2312：KaiTi_GB2312
微软雅黑体：Microsoft YaHei
如果想看详细的，可以参考这个链接
4. draw_networkx_edges()
绘制图形G的边
draw_networkx_edges(G, pos,edgelist=None, width=1.0,edge_color='k',style='solid',alpha=None,
edge_cmap=None,edge_vmin=None,edge_vmax=None,ax=None,
arrows=True,label=None,**kwds)
| 参数 | 类型 | 意义 |
|---|---|---|
| G | 必选 | 网络图 |
| pos | 字典，可选 | 以节点为键，位置为值的字典 ，位置应为长度为2的序列 |
| edgelist | 边缘元组的集合 | 仅绘制指定的边缘，默认= G.edges（） |
| width | float | 边缘的线宽（默认= 1.0） |
| edge_color | 颜色字符串或浮点数数组 | 边缘颜色。可以是单个颜色格式字符串（默认为’r’），也可以是长度与边列表相同的颜色序列。如果指定了数值，则将使用edge_cmap和edge_vmin，edge_vmax参数将它们映射为颜色 |
| style | 字符串 | 边线样式（默认=“实心”）（实心|虚线|点划线，点划线） |
| alpha | 浮点数 | 边缘的线宽（默认= 1.0） |
| edge_ cmap | Matplotlib颜色图 | 用于映射边缘强度的颜色图（默认=无） |
| edge_vmin,edge_vmax | 浮点数 | 边缘颜色图缩放的最小值和最大值（默认为“无”） |
| ax | Matplotlib Axes对象，可选 | 在指定的Matplotlib轴上绘制图形 |
| arrows | 布尔型，可选（默认= True） | 对于有向图，如果为True，请绘制箭头。 |
| label | [None| string] | 图例标签 |
4.1 示例
这里的重点主要是edgelist元组集合的设置，将edge分为了三组，第一组为nodelist1中的点，相互连接的线；第二组为nodelist2中的点，相互连接的线；第三组为nodelist1与nodelist2中的点，相互连接的线；
import networkx as nx
# 创建空的网格
G=nx.Graph()
# 添加节点
G.add_node('JFK')
G.add_nodes_from(['SFO','LAX','ATL','FLO','DFW','HNL'])
# 将节点分类
nodelist1=['SFO','LAX','ATL','FLO']
nodelist2=['DFW','HNL','JFK']# 添加连线
edge_list=[('JFK','SFO'),('JFK','LAX'),('LAX','ATL'),('FLO','ATL'),('ATL','JFK'),('FLO','JFK'),('DFW','HNL')]
G.add_edges_from(edge_list)
# G.add_edges_from([('OKC','DFW'),('OGG','DFW'),('OGG','LAX')])
# 将边分类
edgelist1=[]
for i in range(len(edge_list)):if (edge_list[i][0] in nodelist1) and (edge_list[i][1] in nodelist1):edgelist1.append(edge_list[i])
# print(edgelist1)
edgelist2=[]
for i in range(len(edge_list)):if (edge_list[i][0] in nodelist2) and (edge_list[i][1] in nodelist2):edgelist2.append(edge_list[i])
edgelist3=[]
for i in edge_list:if i not in edgelist1 or edgelist2:edgelist3.append(i)# 绘制网络图
# nx.draw(G)
nx.draw_networkx_nodes(G,pos=nx.shell_layout(G),nodelist=nodelist1,alpha=0.4,node_color='blue',node_shape='p',node_size=[float(len(list(G.neighbors(i)))/len(G.nodes())*200) for i in nodelist1],linewidths=2)
nx.draw_networkx_nodes(G,pos=nx.shell_layout(G),nodelist=nodelist2,alpha=0.4,node_color='red',node_shape='v',node_size=[float(len(list(G.neighbors(i)))/len(G.nodes())*200) for i in nodelist2])nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.shell_layout(G),edgelist=edgelist1,width=1,edge_color='b')
nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.shell_layout(G),edgelist=edgelist2,width=2,edge_color='r')
nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.shell_layout(G),edgelist=edgelist3,width=1,edge_color='k')nx.draw_networkx_labels(G,pos=nx.shell_layout(G),font_sizet=20,font_color='k',font_family='SimHei',alpha=1)
注：如果在“添加连线那部分代码中添加”G.add_edges_from([('OKC','DFW'),('OGG','DFW'),('OGG','LAX')])就会发现，有一部分点是没有连线的，这个就很尴尬，因为分组edgelist的时候，我是按照点来分组的，所以没有nodelist的节点，是没有能够划分到edgelist中的，很遗憾，暂时没有找到很好的解决办法
5. draw_networkx_labels()
draw_networkx_labels(G, pos,labels=None,font_size=12,font_color='k',font_family='sans-serif',font_weight='normal',alpha=1.0,ax=None,**kwds)
| 参数 | 类型 | 意义 |
|---|---|---|
| G | 必选 | 网络图 |
| pos | 字典，可选 | 以节点为键，位置为值的字典 ，位置应为长度为2的序列 |
| labels | 字典，可选（默认=无） | 字典中的节点标签，由文本标签的节点作为键控 |
| font_sizet | int | 文本标签的字体大小（默认值= 12） |
| font_color | 字符串 | 字体颜色字符串（默认='k’黑色） |
| font_family | 边缘元组的集合 | 字体（默认=“ sans-serif”） |
| font_weight | 字符串 | 字体粗细（默认=“正常”） |
| alpha | 浮动 | 文字透明度（默认= 1.0） |
| ax | Matplotlib Axes对象，可选 | 在指定的Matplotlib轴上绘制图形 |
5.1 示例
import networkx as nx
# 创建空的网格
G=nx.Graph()
# 添加节点
G.add_node('JFK')
G.add_nodes_from(['SFO','LAX','ATL','FLO','DFW','HNL'])
# 将节点分类
nodelist1=['SFO','LAX','ATL','FLO']
nodelist2=['DFW','HNL','JFK']# 添加连线
G.add_edges_from([('JFK','SFO'),('JFK','LAX'),('LAX','ATL'),('FLO','ATL'),('ATL','JFK'),('FLO','JFK'),('DFW','HNL')])
# G.add_edges_from([('OKC','DFW'),('OGG','DFW'),('OGG','LAX')])
# 将边分类
edgelist1=[]
tup=()
for u in nodelist1:for v in nodelist1:if str(v) != str(u):tup=(u,v)edgelist1.append(tup)else:passedgelist2=[]
tup=()
for u in nodelist2:for v in nodelist2:if str(v) != str(u):tup=(u,v)edgelist2.append(tup)else:passedgelist3=[]
tup=()
for u in nodelist1:for v in nodelist2:if str(v) != str(u):tup=(u,v)edgelist3.append(tup)else:pass# 绘制网络图
nx.draw_networkx_nodes(G,pos=nx.circular_layout(G),nodelist=nodelist1,alpha=0.4,node_color='blue',node_shape='p',node_size=200,linewidths=2)
nx.draw_networkx_nodes(G,pos=nx.circular_layout(G),nodelist=nodelist2,alpha=0.4,node_color='red',node_shape='v',node_size=220)nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.circular_layout(G),edgelist=edgelist1,width=2,edge_color='b')
nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.circular_layout(G),edgelist=edgelist2,width=2,edge_color='r')
nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.circular_layout(G),edgelist=edgelist3,width=2,edge_color='k')nx.draw_networkx_labels(G,pos=nx.circular_layout(G),font_sizet=15,font_color='k',font_family='SimHei',alpha=0.8)
此处和4里面有些区别，代码运行没问题，逻辑上有些问题，代码就不修改了，留作提醒
6.draw_networkx_edge_labels()
绘制边缘标签，这个边缘标签是指连线上添加标签内容
draw_networkx_edge_labels(G, pos,edge_labels=None,label_pos=0.5,font_size=10,font_color='k',font_family='sans-serif',font_weight='normal',alpha=1.0,bbox=None,ax=None,rotate=True,**kwds)
| 参数 | 类型 | 意义 |
|---|---|---|
| G | 必选 | 网络图 |
| pos | 字典，可选 | 以节点为键，位置为值的字典 ，位置应为长度为2的序列 |
| ax | Matplotlib Axes对象，可选 | 在指定的Matplotlib轴上绘制图形 |
| alpha | float | 文字透明度（默认= 1.0） |
| edge_labels | 字典 | 字典中的边缘标签由文本标签的边缘二元组（默认为“无”）作为键。仅绘制字典中键的标签 |
| label_pos | float | 边缘标签沿边缘的位置（0 =头，0.5 =中心，1 =尾部） |
| font_size | int | 文本标签的字体大小（默认值= 12） |
| font_color | font_color | 字体颜色字符串（默认='k’黑色） |
| font_weight | 字符串 | 字体粗细（默认=“正常”） |
| font_family | 字符串 | 字体家族（默认=“ sans-serif”） |
| bbox | Matplotlib bbox | 指定文本框的形状和颜色 |
| clip_on | 布尔 | 在轴边界处启用裁剪（默认= True） |
6.1 示例
import networkx as nx
# 创建空的网格
G=nx.Graph()
# 添加节点
G.add_node('JFK')
G.add_nodes_from(['SFO','LAX','ATL','FLO','DFW','HNL'])
# 将节点分类
nodelist1=['SFO','LAX','ATL','FLO']
nodelist2=['DFW','HNL','JFK']# 添加连线
G.add_edges_from([('JFK','SFO'),('JFK','LAX'),('LAX','ATL'),('FLO','ATL'),('ATL','JFK'),('FLO','JFK'),('DFW','HNL')])
# G.add_edges_from([('OKC','DFW'),('OGG','DFW'),('OGG','LAX')])
# 将边分类
edgelist1=[]
tup=()
for u in nodelist1:for v in nodelist1:if str(v) != str(u):tup=(u,v)edgelist1.append(tup)else:passedgelist2=[]
tup=()
for u in nodelist2:for v in nodelist2:if str(v) != str(u):tup=(u,v)edgelist2.append(tup)else:passedgelist3=[]
tup=()
for u in nodelist1:for v in nodelist2:if str(v) != str(u):tup=(u,v)edgelist3.append(tup)else:pass# 绘制网络图
nx.draw_networkx_nodes(G,pos=nx.circular_layout(G),nodelist=nodelist1,alpha=0.4,node_color='blue',node_shape='p',node_size=200,linewidths=2)
nx.draw_networkx_nodes(G,pos=nx.circular_layout(G),nodelist=nodelist2,alpha=0.4,node_color='red',node_shape='v',node_size=220)nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.circular_layout(G),edgelist=edgelist1,width=2,edge_color='b')
nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.circular_layout(G),edgelist=edgelist2,width=2,edge_color='r')
nx.draw_networkx_edges(G,pos=nx.circular_layout(G),edgelist=edgelist3,width=2,edge_color='k')nx.draw_networkx_labels(G,pos=nx.circular_layout(G),font_sizet=15,font_color='k',font_family='SimHei',alpha=1)nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos=nx.circular_layout(G))
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