casual discovery Toolbox使用

cdt(casual discovery Toolbox)是一个用于因果关系发现的开源工具包,里面包括10多个算法。其中一些是用R语言开发的所以需要安装R的一些东西。

1.安装R和RStudio,Rtools

安装R和RStudio
安装Rtools

2.RStudio常用代码

1.安装包:install.packages(‘包名’)

2.python代码中配置环境

import os
os.environ["R_HOME"] = r"C:\Program Files\R\R-3.6.3"
os.environ["PATH"]   = r"C:\Program Files\R\R-3.6.3\bin\x64" + ";" + os.environ["PATH"]

3.安装github上的包

3.重要网址

casual discovery Toolbox官方教程
Bioconductor官网(备注:当需要的包CRAN没有的时候,可以到这个网站找找)

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