以后研究自闭症谱系障碍(ASD),为此学习使用DPABI对fMRI数据进行分析,本篇博客记录DPABI的安装以及运行过程中遇到的问题。

严老师官方教程:The R-fMRI Course
bilibili转载的过往教程:rs-fMRI原理与数据分析,DPABI教程
虚家峰老师的基础教程:静息态功能性磁振影像分析操作 Resting-State fMRI analysis in anction
虚家峰老师的主页:磁振影像原理與臨床研究應用

下载软件

第一步我们需要到严老师创建的论坛里下载DPABI:http://rfmri.org/dpabi

下载完之后为了方便各种matlab插件的管理可以选择性地放入到matlab的toolbox中,当然也可以选择放在其他地方。一般这个文件夹的位置是:matlab的安装地址/toolbox

第二步我们需要下载SPM,进入到SPM官网

选择好后点击最下方Download即可,也推荐将整个文件夹放入matlab的toolbox中方便管理。

添加进matlab

下载好后,我们需要将这个插件的地址放进matlab中

点击设置路径,将DPABI文件夹的添加进路径即可,如下图所示,只需要选择图示路径即可,点击选择文件夹后会自动添加进路径

如下图所示即完成添加,点击保存便将DPABI添加进matlab中

同样的方法将SPM也添加进matlab的路径中去

调试

完成上述步骤后便可尝试安装的DPABI是否可用,首先我们去严老师的官网下载demo数据
在matlab的命令行输入dpabi,出现弹框按确定就好,之后就打开了我们的dpabi,如下图所

顺着点击即可来到DPARSFA,在working Directory中选择我们的Demo数据,选到包含FunRaw还有T1Raw的文件夹即可,然后模板我们选择默认模板(即框出来的下拉框课不动),Time Points和TR最好填上,但是如果不清楚的话可以让它等于0,这样就会根据输入的数据来确定Time Pints与TR,但是这种方法不是一直都准确的,因此如果知道的话还是填上比较稳妥。Starting Directory Name选择FunRaw,然后点击Run按钮运行。运行时间较长,等所有都运行完毕即可出现结果。

运行结果如下图所示,之后进行Reorient就可以啦:

问题

一、当出现如下图所示问题的时候,说明没有安装SPM,只需要去SPM官网下载一下即可(如果直接从DPARSFA官网下载的需要下载最新版本的SPM)

二、当出现关于SPM内某个函数出现错误时,说明是SPM版本不对,只需要去SPM官网下载其他版本,一般是最新版本的SPM。

三、出现以下情况时是网络连接不稳定,可以选择换个网络。

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