python的图导入origin_利用Origin软件做X射线倒易空间图(RSM)的办法

使用衍射仪收集完成倒易空间图数据以后，衍射图用到文章里时都需要二次作图，而仪器原生软件做出的图均无法编辑，不利于文章的发表。这里我演示如何将实验的csv数据利用OriginLab作RSM图。

1. 数据转化

我们这里拿到的数据是csv格式，数据三列，2theta，omega，intensity，如下图，已将头部冗余的信息删除。

正空间角度数据转换为倒易空间坐标数据，具体的公式如下

其中R为入射和衍射波矢，大小一般取1/lambda或2pi/lambda.

数据可以在origin中进行转换，或者利用matlab或python编写脚本进行处理。

如下为matlab转换代码

M=csvread('RSM01.csv'); // 读入原始数据文件RSM01.csv

x=M(:,1)*pi/180;

y=M(:,2)*pi/180;

z=M(:,3);

// 处理数据

RC=2*pi/1.540598;

Qx=RC*(cos(y)-cos(x-y));

Qy=RC*(sin(y)+sin(x-y));

M1(:,1)=Qx;

M1(:,2)=Qy;

M1(:,3)=z;

csvwrite('RSM_out.csv',M1)// 将处理后的数据写入到文件RSM_out.csv

Python脚本请自行编写。如有需要请在后台发信息索取。

2. Origin作RSM图

打开origin(这里用的是origin2017版，使用早期版本可能会导致作图不成功)，导入已经处理过的数据(或者利用origin处理好的数据)，plot-contour-color fill作图如下：

鼠标双击中间蓝色区域，打开plot details对话框，选择colormap/contours选项卡对图像进行适当设置，如下图所示。

其中level是对图像中衍射强度显示模式进行设置，这里选择log10，注意起始强度要改为非零正数。为了图像更细腻一些，右边的levels改为50

Fill选项是设置图像显示颜色，可以根据自己喜好进行设置，这里使用默认，并把小于1的强度设为起始蓝色。

Line主要设置轮廓线的属性，这里设置为隐藏轮廓线，作图如下

之后根据自己的喜好，再对所得到的图进行比例、坐标等调整设置，最后做好的图如下图所示。此时，图片就可以在文章中使用了。

最后需要说明的是，这里使用的数据是利用帕纳科公司仪器测试所得，其他公司数据处理过程类似。

本文原载于公众号：X射线衍射(ID：X-RayScattering)，欢迎关注！

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