recon-all 命令

# 修改环境变量 SUBJECTS_DIR
export SUBJECTS_DIR=/nfs/s2/userhome/zhou/MAI/
recon-all -s MZX_reconAll -i ${Source_dir}/data.anat/T1_biascorr_brain.nii.gz -all

输出平面类型

Pial surface (red) and white surface (blue):

(图转自 https://andysbrainbook.readthedocs.io/en/latest/FreeSurfer/FS_ShortCourse/FS_03_ReconAll.html)

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Recon-all命令实例

recon-all 命令

输出平面类型

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